3'UTR

Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
Skocz do: nawigacji, wyszukiwania

3'UTR, 3' obszar nieulegający translacji (ang. 3' untranslated region) – nieulegająca translacji część mRNA położona w kierunku 3' od sekwencji kodującej (u eukariontów między sekwencją kodującą a ogonem poli-A).

W obszarze 3'UTR mogą się znajdować różne sekwencje sygnałowe:

  • sekwencje będące sygnałem do poliadenylacji, zazwyczaj AAUAAA[1];
  • sekwencje wpływające na lokalizację mRNA w komórce[2];
  • sekwencje wpływające na stabilność mRNA (np. sekwencje AURE bogate w adeninę i uracyl)[3];
  • sekwencje wpływające na translację[4]
  • miejsca wiązania miRNA[5]

Mutacje w 3'UTR mogą powodować choroby genetyczne, np. mutacja punktowa sygnału do poliadenylacji w genie kodującym β-globinę mogą powodować talasemię, a mutacja dynamiczna polegająca na ekspansji sekwencji nukleotydowej (trójka nukleotydów CTG) położonej w 3'UTR genu DMPKdystrofię miotoniczną typu 1[6].

Przypisy

  1. Ara, T, Lopez, F, Ritchie, W, Benech, P, Gautheret, D. Conservation of alternative polyadenylation patterns in mammalian genes. „BMC Genomics”. 7, s. 189, 2006. PMID 16872498. 
  2. Hesketh, J. 3'-Untranslated regions are important in mRNA localization and translation: lessons from selenium and metallothionein. „Biochem Soc Trans”. Pt 6, s. 990-993, 2004. PMID 15506944. 
  3. Barreau, C, Paillard, L, Osborne, HB. U-rich elements and associated factors: are there unifying principles?. „Nucleic Acids Res”. 33. 22, s. 7138-7150, 2006. PMID 16391004. 
  4. Mazumder, B, Sampath, P, Fox, PL. Regulation of macrophage ceruloplasmin gene expression: one paradigm of 3'-UTR-mediated translational control. „Mol Cells”. 20. 2, s. 167-172, 2005. PMID 16267389. 
  5. Yang, M, Li, Y, Padgett, RW. MicroRNAs: Small regulators with a big impact. „Cytokine Growth Factor Rev”. 16. 4-5, s. 387-93, 2005. doi:10.1016/j.cytogfr.2005.02.008. PMID 15869899. 
  6. Chen, JM, Ferec, C, Cooper, DN. A systematic analysis of disease-associated variants in the 3' regulatory regions of human protein-coding genes II: the importance of mRNA secondary structure in assessing the functionality of 3' UTR variants. „Hum Genet”. 120. 3, s. 301-333, 2006. doi:10.1007/s00439-006-0218-x. PMID 16807757.