3'UTR
Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
3'UTR, 3' obszar nieulegający translacji (ang. 3' untranslated region) – nieulegająca translacji część mRNA położona w kierunku 3' od sekwencji kodującej (u eukariontów między sekwencją kodującą a ogonem poli-A).
W obszarze 3'UTR mogą się znajdować różne sekwencje sygnałowe:
- sekwencje będące sygnałem do poliadenylacji, zazwyczaj AAUAAA[1];
- sekwencje wpływające na lokalizację mRNA w komórce[2];
- sekwencje wpływające na stabilność mRNA (np. sekwencje AURE bogate w adeninę i uracyl)[3];
- sekwencje wpływające na translację[4]
- miejsca wiązania miRNA[5]
Mutacje w 3'UTR mogą powodować choroby genetyczne, np. mutacja punktowa sygnału do poliadenylacji w genie kodującym β-globinę mogą powodować talasemię, a mutacja dynamiczna polegająca na ekspansji sekwencji nukleotydowej (trójka nukleotydów CTG) położonej w 3'UTR genu DMPK – dystrofię miotoniczną typu 1[6].
Przypisy
- ↑ Ara, T, Lopez, F, Ritchie, W, Benech, P, Gautheret, D. Conservation of alternative polyadenylation patterns in mammalian genes. „BMC Genomics”. 7, s. 189, 2006. PMID 16872498.
- ↑ Hesketh, J. 3'-Untranslated regions are important in mRNA localization and translation: lessons from selenium and metallothionein. „Biochem Soc Trans”. Pt 6, s. 990-993, 2004. PMID 15506944.
- ↑ Barreau, C, Paillard, L, Osborne, HB. U-rich elements and associated factors: are there unifying principles?. „Nucleic Acids Res”. 33. 22, s. 7138-7150, 2006. PMID 16391004.
- ↑ Mazumder, B, Sampath, P, Fox, PL. Regulation of macrophage ceruloplasmin gene expression: one paradigm of 3'-UTR-mediated translational control. „Mol Cells”. 20. 2, s. 167-172, 2005. PMID 16267389.
- ↑ Yang, M, Li, Y, Padgett, RW. MicroRNAs: Small regulators with a big impact. „Cytokine Growth Factor Rev”. 16. 4-5, s. 387-93, 2005. doi:10.1016/j.cytogfr.2005.02.008. PMID 15869899.
- ↑ Chen, JM, Ferec, C, Cooper, DN. A systematic analysis of disease-associated variants in the 3' regulatory regions of human protein-coding genes II: the importance of mRNA secondary structure in assessing the functionality of 3' UTR variants. „Hum Genet”. 120. 3, s. 301-333, 2006. doi:10.1007/s00439-006-0218-x. PMID 16807757.
