Izoschizomery

Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
Skocz do: nawigacji, wyszukiwania

Izoschizomery (gr. σχίζω, skhízō - rozdzierać, ciąć + izomer) to enzymy restrykcyjne rozpoznające tę samą sekwencję DNA[1].

Swoimi izoschizomerami są na przykład enzymy SphI, rozponający i tnący sekwencję 5'-CGTACG-3' i BbuI, także rozpoznający i tnący 5'-CGTACG-3'[2]. Zwykle pierwszy poznany enzym rozpoznający i trawiący daną sekwencję jest prototypem rodziny, a każdy następny uważany jest za jego izoschizomer. Izoschizomery są zazwyczaj izolowane z różnych szczepów bakterii, w związku z czym mogą wymagać różnych warunków reakcji.

Z kolei enzymy, który rozpoznaje tę sama sekwencję, ale tną ją w różnych miejscach, zwane są neoschizomerami. Neoschizomery są specyficznym podtypem izoschizomerów[1].

Przykładem neoschizomerów są enzymy SmaI, rozpoznający i tnący sekwencję 5'-GGGCCC-3' i XmaI, rozpoznający tę samą sekwencję, ale tnący ją w innym miejscu - 5'-GGGCCC-3'[3].

Przypisy

  1. 1,0 1,1 Isoschizomers (ang.). New England Biolabs, Inc. [dostęp 2010-04-19].
  2. E. Aubert, S. Spurgeon, W. Ray, J. Davies. Purification and characterization of an isoschizomer of SphI from Bacillus circulans.. „Nucleic Acids Res”. 18 (20), s. 6152, Oct 1990. PMID 2146591. 
  3. BE. Froman, RC. Tait, CI. Kado, RL. Rodriguez. Purification of restriction endonuclease XcyI from Xanthomonas cyanopsidis.. „Gene”. 28 (3), s. 331-5, Jun 1984. PMID 6086461.