Protein Data Bank

Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
Skocz do: nawigacja, szukaj

Protein Data Bank, w skrócie PDB (pol. Bank Danych Białkowych) to baza danych zawierająca przede wszystkim dane o strukturze przestrzennej białek i kwasów nukleinowych.

Dane o tych makrocząsteczkach uzyskane m.in. za pomocą rentgenografii strukturalnej i spektroskopii NMR zawierają bibliografię, sekwencje aminokwasowe, informacje o strukturze drugorzędowej oraz, przede wszystkim, współrzędne atomów.

Na dzień 2013-03-29 baza PDB zawierała 89212 zdeponowanych struktur[1]:

Metoda Białka Kwasy nukleinowe Kompleksy białko/kwas nukleinowy Inne W sumie
Rentgenografia strukturalna 73384 1447 3775 2 78608
Spektroskopia NMR 8645 1025 192 7 9869
Mikroskopia elektronowa 349 41 124 0 514
Metody mieszane 46 3 2 1 52
Inne 146 4 6 13 169
W sumie 82570 2520 4099 23 89212

Przypisy

  1. PDB Current Holdings Breakdown. [dostęp 2013-03-29].

Linki zewnętrzne[edytuj | edytuj kod]