Karierę piłkarską Peeters rozpoczynał w klubie Lierse SK. W 1992 roku zadebiutował w jego barwach w pierwszej lidze belgijskiej, a w sezonie 1994/1995 stał się podstawowym zawodnikiem tego zespołu. W sezonie 1996/1997 wywalczył z Lierse mistrzostwo Belgii.
Latem 1997 Peeters przeszedł z Lierse do holenderskiejRody Kerkrade. W Eredivisie zadebiutował 20 sierpnia 1997 roku w wygranym 1:0 domowym meczu z FC Utrecht. 24 września 1997 w meczu z NEC Nijmegen (4:0) strzelił swoje pierwsze 2 gole w lidze holenderskiej. W 2000 roku zdobył z Rodą Puchar Holandii. Przez 3 sezony strzelił dla Rody 39 goli.
W 2000 roku Peeters odszedł do SBV Vitesse. W Vitesse swoje pierwsze ligowe spotkanie rozegrał 20 sierpnia 2000, wygrane 3:1 z FC Twente, w którym Peeters zdobył gola. W drużynie Vitesse występował do lata 2003 roku.
Kolejnym klubem w karierze Peetersa był angielskiMillwall, grający w Division One. Zadebiutował w nim 23 sierpnia 2003 w zremisowanym 1:1 domowym spotkaniu z Crewe Alexandra. W Millwall grał przez 2 lata.
W 2005 roku Peeters wrócił do Belgii i został piłkarzem KRC Genk. Swój debiut w nim zaliczył 28 sierpnia 2005 w meczu z Anderlechtem (3:3). Po roku gry w Genk wrócił do Lierse, z którym w 2007 roku spadł z pierwszej do drugiej ligi. W 2008 roku zakończył karierę piłkarską.
Stany Zjednoczone
Luksemburg
Bułgaria
Chorwacja
Łotwa
San Marino
Szkocja
Czechy
Finlandia
