Juan Ramon karierę rozpoczynał w La Placie, gdzie w 1998 roku podpisał kontrakt z Estudiantes La Plata. Po 4 latach gry w tym klubie przeniósł się do niemieckiego klubu Borussia Dortmund, jednak nie wywalczył w tym klubie miejsca w składzie i już po roku powrócił do Argentyny na roczne wypożyczenie do River Plate. Występy w tym zespole pozwoliły mu odbudować formę i po powrocie do Niemiec oczekiwał dużo lepszej gry. Po raz kolejny jednak więcej czasu spędzał na ławce rezerwowych i w sezonie 2005/2006 grał już w barwach San Lorenzo de Almagro. W 2006 roku po raz kolejny zmienił klub i został zawodnikiem CA Colón. W sezonie 2008/2009 grał w Argentinos Juniors Buenos Aires, a w 2009/2010 - w Skodzie Ksanti. W 2010 roku przeszedł do Atlético Rafaela.
