Pirolizyna

Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Pirolizyna
Niepodpisana grafika związku chemicznego; prawdopodobnie struktura chemiczna bądź trójwymiarowy model cząsteczki Niepodpisana grafika związku chemicznego; prawdopodobnie struktura chemiczna bądź trójwymiarowy model cząsteczki
Ogólne informacje
Wzór sumaryczny C12H21N3O3
Masa molowa 255,31 g/mol
Identyfikacja
Numer CAS 448235-52-7
PubChem 5460671[1]

Pirolizyna, pirololizyna (skróty: Pyl, O) – organiczny związek chemiczny z grupy α-aminokwasów. Występuje w białkach metanogennych archeowców (np. Methanococcoides burtoni, M. acetivorans, M. mazei i M. thermophila) oraz bakterii Desulfitobacterium hafniense. Jest kodowana przez kodon UAG, zwykle będący kodonem stop[2][3]. Razem z selenocysteiną są określane jako 21 i 22 aminokwas białkowy[3]. Wchodzi w skład metylotransferazy uczestniczącej w syntezie metanu w Methanosarcina barkeri[4][5]. W komórce tego organizmu potwierdzono występowanie genu pylT kodującego tRNA z antykodonem CUA. tRNA jest specyficzne dla odkrytego aminokwasu[4]. In vivo pirolizyna powstaje w skutek połączenia dwóch cząsteczek lizyny[6].

Przypisy[edytuj | edytuj kod]

  1. Pirolizyna (CID: 5460671) (ang.) w bazie PubChem, United States National Library of Medicine.
  2. publikacja w otwartym dostępie – możesz ją przeczytać Y. Zhang, P.V. Baranov, J.F. Atkins, V.N. Gladyshev. Pyrrolysine and selenocysteine use dissimilar decoding strategies. „Journal of Biological Chemistry”. 280 (21), s. 20740–20751, 2005. DOI: 10.1074/jbc.M501458200. PMID: 15788401. 
  3. a b publikacja w otwartym dostępie – możesz ją przeczytać Y. Zhang, V.N. Gladyshev. High content of proteins containing 21st and 22nd amino acids, selenocysteine and pyrrolysine, in a symbiotic deltaproteobacterium of gutless worm Olavius algarvensis. „Nucleic Acids Research”. 35 (15), s. 4952–4963, 2007. DOI: 10.1093/nar/gkm514. PMID: 17626042. PMCID: PMC1976440. 
  4. a b G. Srinivasan, C.M. James, J.A. Krzycki. Pyrrolysine encoded by UAG in Archaea: charging of a UAG-decoding specialized tRNA. „Science”. 296 (5572), s. 1459–1462, 2002. DOI: 10.1126/science.1069588. PMID: 12029131. 
  5. B. Hao, W. Gong, T.K. Ferguson, C.M. James i inni. A new UAG-encoded residue in the structure of a methanogen methyltransferase. „Science”. 296 (5572), s. 1462–1466, 2002. DOI: 10.1126/science.1069556. PMID: 12029132. 
  6. Publikacja w otwartym dostępie – możesz ją bezpłatnie przeczytać Marsha A. Gaston i inni, The complete biosynthesis of the genetically encoded amino acid pyrrolysine from lysine, „Nature”, 471 (7340), 2011, s. 647–650, DOI10.1038/nature09918, ISSN 1476-4687, PMID21455182, PMCIDPMC3070376 [dostęp 2018-06-15].