SARS-CoV-2: Różnice pomiędzy wersjami

Edytuj linki
Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
Przeglądaj historię interaktywnie
[wersja przejrzana][wersja przejrzana]
← poprzednia edycjanastępna edycja →
Usunięta treść Dodana treść
WizualnieWikikod
Kenraiz (dyskusja | edycje)
Redaktorzy
104 191 edycji
drobne merytoryczne
→‎Filogenetyka: drobne redakcyjne, int.
Linia 163: Linia 163:
== Filogenetyka ==
== Filogenetyka ==
[[Plik:2019-nCoV genome.svg|mały|Organizacja genomu]]
[[Plik:2019-nCoV genome.svg|mały|Organizacja genomu]]
Sekwencje koronawirusa Wuhana wykazują podobieństwa do betakoronawirusów znalezionych u nietoperzy<ref>{{Cytuj |tytuł = Coronavirus |data dostępu = 2020-01-23 |opublikowany = www.who.int |url = https://www.who.int/westernpacific/health-topics/coronavirus |język = en}}</ref>. Wirus ten jest jednak genetycznie odmienny od innych koronawirusów, takich jak koronawirus związany z ([[SARS]]) i koronawirus związany z ([[Bliskowschodni zespół oddechowy|MERS]])<ref>{{Cytuj |tytuł = auspice |data dostępu = 2020-01-23 |opublikowany = nextstrain.org |url = https://nextstrain.org/groups/blab/sars-like-cov}}</ref>.
Sekwencje koronawirusa 2019-nCoV wykazują podobieństwa do betakoronawirusów znalezionych u nietoperzy<ref>{{Cytuj |tytuł = Coronavirus |data dostępu = 2020-01-23 |opublikowany = www.who.int |url = https://www.who.int/westernpacific/health-topics/coronavirus |język = en}}</ref>. Wirus ten jest jednak genetycznie odmienny od innych koronawirusów, takich jak koronawirus związany z ([[SARS]]) i koronawirus związany z ([[Bliskowschodni zespół oddechowy|MERS]])<ref>{{Cytuj |tytuł = auspice |data dostępu = 2020-01-23 |opublikowany = nextstrain.org |url = https://nextstrain.org/groups/blab/sars-like-cov}}</ref>.


Wyizolowano i opisano pięć genomów nowego koronawirusa, w tym<ref>{{Cytuj |tytuł = Novel 2019 coronavirus genome |data = 2020-01-11 |data dostępu = 2020-01-23 |opublikowany = Virological |url = http://virological.org/t/novel-2019-coronavirus-genome/319 |język = en}}</ref>:
Wyizolowano i opisano pięć genomów nowego koronawirusa, w tym<ref>{{Cytuj |tytuł = Novel 2019 coronavirus genome |data = 2020-01-11 |data dostępu = 2020-01-23 |opublikowany = Virological |url = http://virological.org/t/novel-2019-coronavirus-genome/319 |język = en}}</ref>:
# BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019
# BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019;
# BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-04/2020
# BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-04/2020;
# BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-05/2019
# BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-05/2019;
# BetaCoV/Wuhan/WIV04/2019
# BetaCoV/Wuhan/WIV04/2019;
# BetaCoV/Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019
# BetaCoV/Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019.


{| class="wikitable"
{| class="wikitable"

Wersja z 11:24, 27 sty 2020

Wirus 2019-nCoV
ilustracja
Systematyka
Grupa

Grupa IV ((+)ssRNA)

Rząd

Nidowirusy

Rodzina

Koronawirusy

Rodzaj

Betakoronawirus

Cechy wiralne
Skrót

2019-nCoV

Rezerwuar

Człowiek, wąż, nietoperz

Wywoływane choroby

Zapalenie płuc

Wirus 2019-nCoV – wirus RNA należący do rodziny koronawirusów, z pojedynczą nicią o dodatniej polaryzacji ssRNA(+)[1]. Jest to siódmy znany gatunek z rodziny powodujący zachorowania u ludzi[2]. Pierwsze odnotowane przypadki zachorowań ludzi na 2019-nCoV miały miejsce pod koniec 2019 roku w mieście Wuhan w prowincji Hubei w Chińskiej Republice Ludowej[3][4]. Źródłem wirusa może być targ rybny Huanan[5][6], gdzie sprzedawane są zarówno żywe, jak i martwe zwierzęta[7][8]. Wirus rozprzestrzenia się drogą kropelkową, powodując u niektórych chorych ciężkie zapalenie płuc.

Odkrycie

Wirus odkryty został w 2019. W grudniu odnotowano grupę pacjentów cierpiących na zapalenie płuc nieznanej etiologii. Zachorowania te udało się powiązać z miejscem sprzedaży owoców morza w Wuhan w chińskiej prowincji Hubei. Ostatniego dnia roku Chinese Center for Disease Control and Prevention wysłało tam zespół mający wspomóc lokalne władze. Przeprowadzono dochodzenie epidemiologiczne mające pokazać przyczynę zachorowań. W nabłonku dróg oddechowych trzech pacjentów udało się wykryć i wyizolować nieznanego wcześniej wirusa, którego zaklasyfikowano wśród koronawirusów. Odkryto duże podobieństwo genomu (identyczne w 85%) nowego gatunku z beta-koronawirusami linii B izolowanymi wcześniej z nietoperzy – bat SARS-like CoV (bat-SL-CoVZC45, MG772933.1)[2].

Budowa

Wirus 2019-nCoV ma kształt zasadniczo kulisty, choć nieco pleomorficzny, o średnicy 60–140 nm. Otoczony jest wyraźnymi wypustkami (ang. spikes) o długości 9–12 nm nadającymi mu wygląd podobny do korony słonecznej[2].

Historia i statystyka

 Osobny artykuł: Zakażenia nowym koronawirusem (2019–2020).

Pierwsze przypadki nowej choroby, wywołującej zapalenie płuc odnotowano w połowie grudnia 2019 wśród lokalnych mieszkańców związanych z rynkiem zwierząt i owoców morza w Wuhan. Następnie chińscy naukowcy zidentyfikowali nowego koronawirusa-2019-nCoV[9].

  • 8 grudnia 2019 – pierwsze oznaki zachorowań[10].
  • 31 grudnia 2019 – WHO ogłosiła pierwsze podejrzane przypadki zachorowań[11]. Niektóre kraje w pobliżu Chin zaostrzyły kontrolę wybranych podróżnych[6].
  • 7 stycznia 2020 – ogłoszono, że zachorowania powoduje nowy gatunek koronowirusa nazwany 2019-nCoV[12]
  • 13 stycznia 2020 – potwierdzono pierwszą osobę zarażoną wirusem 2019-nCoV poza granicami Chin w Tajlandii. 61-letnia kobieta z Wuhan po przylocie 8 stycznia na lotnisko Bangkok-Suvarnabhumi z powodu gorączki trafiła do szpitala. Pacjentka w dniu ogłoszenia komunikatu pozostawała w stanie stabilnym[13].
  • 15 stycznia 2020 – potwierdzono zarażenie wirusem 2019-nCoV u pacjenta w Japonii, przybyłego z Wuhan do tego kraju 6 stycznia. Po hospitalizacji pacjent tego dnia został zwolniony do domu w stanie stabilnym[14].
  • 20 stycznia 2020 – chiński premier Li Keqiang wezwał do podjęcia zdecydowanych i skutecznych działań w celu zapobiegania i kontroli epidemii zapalenia płuc spowodowanej przez nowy koronawirus[15].
  • 22 stycznia 2020 – Journal of Medical Virology opublikowało raport w którym naukowcy zaobserwowali że wirus może pochodzić od węży. Jednak jak podkreślili naukowcy – teza ta wymaga dalszych badań[16][17]. Jest ona kwestionowana przez niektórych naukowców, którzy twierdzą, że nosicielem musi być ptak lub ssak[18].
  • 23 stycznia 2020 – Światowa Organizacja Zdrowia postanowiła nie uznawać epidemii za stan zagrożenia zdrowia publicznego o zasięgu międzynarodowym. WHO uprzednio ostrzegła, że możliwy jest szerszy wybuch choroby[19]. W mieście Wuhan wprowadzono drastyczne środki prewencyjne – zamknięto lotnisko, odwołano wszelkie imprezy masowe, a władze apelują o unikanie skupisk ludzi. Zachorowało tu ok. 570 osób, a 17 zmarło[20].
  • 24 stycznia 2020 – ogłoszono, że do tego dnia zmarło 26 osób, przy czym nastąpił także pierwszy zgon poza prowincją Hubei, której stolicą jest Wuhan, w Heilongjiang. Infekcję wirusem potwierdzono u 830 pacjentów. Osoby zarażone zakażały do tego czasu średnio od 1,4 do 2,5 innych osób[21]. Pierwszy potwierdzony przypadek zachorowania w Europie. Wirusa zdiagnozowano u dwóch osób: jednej w Paryżu oraz jednej w Bordeaux[22].
  • 25 stycznia 2020 – w Chinach jest ponad 1200 potwierdzonych zarażeń i 41 zmarłych. Pierwsze potwierdzone zachorowania w Europie – trzy we Francji[23].
  • 27 stycznia 2020 – w Chinach jest 2744 potwierdzonych zarażeń, w tym 461 w stanie krytycznym i 80 zmarłych (w tym 74 w prowincji Hubei), 51 osób wcześniej chorych zostało wyleczonych i zwolnionych ze szpitali. Poza granicami Chin zarejestrowano w sumie 44 chorych, z których nikt nie zmarł (8 przypadków w Tajlandii, po 5 w Australii i USA, 4 w Singapurze, na Tajwanie, w Malezji i Południowej Korei, 3 we Francji i Japonii, 2 w Wietnamie, pojedyncze w Nepalu i Kanadzie)[24].
Zachorowania na 2019-nCoV
Państwo Zachorowania Zgony Wyzdrowienia Główne ośrodki zachorowań[25] Ref.
Chiny 1756 55 Wuhan, Pekin, Guangdong, Hubei, Szanghaj, Zhejiang [26]
Tajlandia Tajlandia 7 0 Bangkok [27]
Hongkong Hongkong 5 2 [1]
Australia Australia 4 0 [28]
Malezja Malezja 4 0 [29]
Francja Francja 3 0 Paryż, Bordeaux [30]
Japonia Japonia 3 0 Kanagawa [31]
Singapur Singapur 4 0 [32][33]
Tajwan (Republika Chińska) 3 0 Tajpej [34]
Makau Makau 2 0 [35]
Korea Południowa Korea Południowa 2 0 [36]
Stany Zjednoczone Stany Zjednoczone 5 0 Waszyngton (stan), Illinois, Kalifornia, Arizona, [37]
Wietnam Wietnam 2 0 [38]
Nepal Nepal 1 0 [39]
Podsumowanie: 1756 57

Filogenetyka

Organizacja genomu

Sekwencje koronawirusa 2019-nCoV wykazują podobieństwa do betakoronawirusów znalezionych u nietoperzy[40]. Wirus ten jest jednak genetycznie odmienny od innych koronawirusów, takich jak koronawirus związany z (SARS) i koronawirus związany z (MERS)[41].

Wyizolowano i opisano pięć genomów nowego koronawirusa, w tym[42]:

  1. BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019;
  2. BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-04/2020;
  3. BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-05/2019;
  4. BetaCoV/Wuhan/WIV04/2019;
  5. BetaCoV/Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019.
Informacje genomowe
Identyfikator genomu NCBI MN908947
Rozmiar genomu 30473 zasady
Rok ukończenia 2020

Objawy

W momencie przyjęcia osób hospitalizowanych czynności życiowe w większości przypadków były stabilne[43]. Badania krwi często wykazały niską liczbę białych krwinek (leukopenia i limfopenia)[44][niewiarygodne źródło?][45][niewiarygodne źródło?][46]

  • wysoka gorączka;
  • zmęczenie;
  • kaszel;
  • płytki oddech;
  • trudności z oddychaniem.

Etiologia

Przypisy

  1. ↑ Charles Patrick Davis, Medical Definition of Wuhan Coronavirus [online], MedicineNet, 22 stycznia 2020 [dostęp 2020-01-24] (ang.).
  2. ↑ a b c Na Zhu i inni, A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019, „The New England Journal of Medicine”, 2020, DOI: 10.1056/NEJMoa2001017, PMID: 31978945 (ang.).
  3. ↑ New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert – Xinhua | English.news.cn [online], www.xinhuanet.com [dostęp 2020-01-23].
  4. ↑ 中国疾病预防控制中心 [online], www.chinacdc.cn [dostęp 2020-01-23].
  5. ↑ Jon Cohen, Dennis Normile, New SARS-like virus in China triggers alarm, „Science”, 367 (6475), 2020, s. 234–235, DOI: 10.1126/science.367.6475.234, PMID: 31949058 (ang.).
  6. ↑ a b Jane Parry, China coronavirus: cases surge as official admits human to human transmission, „British Medical Journal”, 368, 2020, DOI: 10.1136/bmj.m236, PMID: 31959587 (ang.).
  7. ↑ Nowy wirus w Chinach zyskał nazwę. Źródłem zakażenia 2019-nCoV mogą być węże [online], www.rmf24.pl [dostęp 2020-01-23] (pol.).
  8. ↑ Promed Post – ProMED-mail [online] [dostęp 2020-01-23] (ang.).
  9. ↑ Promed Post – ProMED-mail [online] [dostęp 2020-01-23] (ang.).
  10. ↑ Lisa Schnirring | News Editor | CIDRAP News | Jan 14, 2020, Report: Thailand’s coronavirus patient didn’t visit outbreak market [online], CIDRAP [dostęp 2020-01-23] (ang.).
  11. ↑ WHO | Pneumonia of unknown cause – China [online], WHO [dostęp 2020-01-23].
  12. ↑ Novel Coronavirus (2019-nCoV). World Health Organization. [dostęp 2020-01-26].
  13. ↑ Novel Coronavirus – Thailand (ex-China). [w:] Disease outbreak news [on-line]. World Health Organization, 14 stycznia 2020. [dostęp 2020-01-25].
  14. ↑ Novel Coronavirus – Japan (ex-China). [w:] Disease outbreak news [on-line]. World Health Organization, 17 stycznia 2020. [dostęp 2020-01-25].
  15. ↑ 郭凯, Chinese premier stresses curbing viral pneumonia epidemic – Chinadaily.com.cn [online], www.chinadaily.com.cn [dostęp 2020-01-23].
  16. ↑ Deutsche Welle (www.dw.com), Naukowcy: Koronawirusy mogą pochodzić od dwóch gatunków zwierząt [online], DW.COM [dostęp 2020-01-23] (pol.).
  17. ↑ Wei Ji i inni, Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross-species transmission from snake to human, „Journal of Medical Virology”, 2020, DOI: 10.1002/jmv.25682 (ang.).
  18. ↑ Ewen Callaway, David Cyranoski, Why snakes probably aren’t spreading the new China virus, „Nature”, 2020, DOI: 10.1038/d41586-020-00180-8 (ang.).
  19. ↑ Statement on the meeting of the International Health Regulations (2005) Emergency Committee regarding the outbreak of novel coronavirus 2019 (n-CoV) on 23 January 2020 [online], www.who.int [dostęp 2020-01-23] (ang.).
  20. ↑ Paweł Kalisz: Wuhan zamknięte na głucho. Jest film, jak wygląda życie w mieście walczącym z koronawirusem. naTemat.pl, 2020-01-23. [dostęp 2020-01-23]. (pol.).
  21. ↑ China coronavirus: Death toll rises as more cities restrict travel. [w:] BBC News [on-line]. [dostęp 2020-01-24].
  22. ↑ Dwa przypadki koronawirusa we Francji. To pierwsze zakażenia w Europie [online], www.rmf24.pl [dostęp 2020-01-24] (pol.).
  23. ↑ China coronavirus: Death toll rises as disease spreads. [dostęp 2020-01-25].
  24. ↑ Coronavirus: Death toll rises to 80 as China extends holiday. [w:] BBC News [on-line]. 2020-01-27. [dostęp 2020-01-27].
  25. ↑ Geographical distribution of 2019-nCov cases [online], European Centre for Disease Prevention and Control [dostęp 2020-01-23] (ang.).
  26. ↑ 全国新型肺炎疫情实时动态 – 丁香园·丁香医生 [online], 3g.dxy.cn [dostęp 2020-01-25].
  27. ↑ Hong Kong finds first case of Wuhan virus: sources – RTHK [online], news.rthk.hk [dostęp 2020-01-23] (ang.).
  28. ↑ Coronavirus: Three confirmed cases of infection in NSW, one in Victoria [online], www.9news.com.au [dostęp 2020-01-25].
  29. ↑ Malaysiakini, Wuhan man becomes fourth coronavirus victim in M’sia [online], Malaysiakini, 25 stycznia 2020 [dostęp 2020-01-25] (ang.).
  30. ↑ First cases of coronavirus confirmed in Europe [online], Evening Standard, 24 stycznia 2020 [dostęp 2020-01-24] (ang.).
  31. ↑ China virus cases triple as infection spreads, „BBC News”, 20 stycznia 2020 [dostęp 2020-01-23] (ang.).
  32. ↑ hermesauto, Singapore confirms first case of Wuhan virus [online], The Straits Times, 23 stycznia 2020 [dostęp 2020-01-23] (ang.).
  33. ↑ 4th confirmed case of Wuhan virus in Singapore: MOH [online], CNA [dostęp 2020-01-25] (ang.).
  34. ↑ CDC, 2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV) [online], Centers for Disease Control and Prevention, 21 stycznia 2020 [dostęp 2020-01-23] (ang.).
  35. ↑ 第2宗武漢肺炎66歲男遊客確診 花車匯演取消 [online], on.cc東網 [dostęp 2020-01-23] (chiń.).
  36. ↑ Tomasz Dereszyński, Nowy wirus w Chinach. Ile osób zachorowało? Jakie są objawy? 11-milionowe Wuhan odcięte od świata. Koronawirus nCoV zabija kolejne osoby [online], Echo Dnia Podkarpackie, 24 stycznia 2020 [dostęp 2020-01-24] (pol.).
  37. ↑ Faith Karimi, Eliott C. McLaughlin: Fifth US case of coronavirus confirmed as China warns people can spread the virus before they feel ill. [w:] CNN [on-line]. Cable News Network,Turner Broadcasting System, Inc., 26.01.2020. [dostęp 2020-01-26].
  38. ↑ VnExpress, Vietnam confirms first acute pneumonia cases in Saigon – VnExpress International [online], VnExpress International – Latest news, business, travel and analysis from Vietnam [dostęp 2020-01-23] (ang.).
  39. ↑ First case of coronavirus in Nepal after student who returned from Wuhan tests postive [online], www.aninews.in [dostęp 2020-01-25] (ang.).
  40. ↑ Coronavirus [online], www.who.int [dostęp 2020-01-23] (ang.).
  41. ↑ auspice [online], nextstrain.org [dostęp 2020-01-23].
  42. ↑ Novel 2019 coronavirus genome [online], Virological, 11 stycznia 2020 [dostęp 2020-01-23] (ang.).
  43. ↑ 武汉市卫生健康委员会 [online], wjw.wuhan.gov.cn [dostęp 2020-01-23].
  44. ↑ Michał Korn, Koronawirus 2019-nCoV zabił już 4 osoby. Nie ma na niego lekarstwa. Potwierdzono przypadek zarażenia w USA. WHO ostrzega przed epidemią [online], Gazeta Lubuska, 22 stycznia 2020 [dostęp 2020-01-23] (pol.).
  45. ↑ Koronawirus. Co wiemy o nim do tej pory [online], TVN24 [dostęp 2020-01-23].
  46. ↑ WHO says new China coronavirus could spread, warns hospitals worldwide, „Reuters”, 14 stycznia 2020 [dostęp 2020-01-23] (ang.).
  47. ↑ Wirus z Chin. Jakie są Objawy? Koronawirus dotrze do Polski? Alert na lotnisku Chopina z powodu WHO 2019-nCoV [online], Głos Koszaliński, 23 stycznia 2020 [dostęp 2020-01-23] (pol.).
Źródło: „https://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=SARS-CoV-2&oldid=58623862”