Metagenomika
Wygląd
Metagenomika – bezpośrednie klonowanie, sekwencjonowanie i funkcjonalna analiza materiału genetycznego izolowanego z różnych nisz ekologicznych.
Składa się z pięciu etapów:
- Izolacja DNA – próbka jest pobierana z naturalnego środowiska flory bakteryjnej, zawiera różne typy mikroorganizmów. Komórki bakterii mogą być otwierane za pomocą metod chemicznych (np. silnie zasadowy odczyn) lub za pomocą fizycznych (np. sonikacja).
- Cięcie na mniejsze fragmenty przy pomocy enzymów restrykcyjnych i wklonowywanie w wektory.
- Wprowadzenie wektorów z insertem z DNA do modelowego organizmu (najczęściej jest to Escherichia coli).
- Hodowla komórek na selektywnych mediach (każda komórka jest początkiem dla kolonii komórek powstałych wskutek podziałów tej pierwszej).
- Analiza DNA z metagenomowych bibliotek.
Jeden z najbardziej znanych projektów metagenomiki dotyczył sekwencjonowania DNA z Morza Sargassowego. Jego rezultatem była identyfikacja wielu nieznanych genów.
Bibliografia[edytuj | edytuj kod]
- Piotr Węgleński: Genetyka molekularna. Warszawa: 2008.