Plik:Phylogenetic tree of coronaviruses.jpg

Grafika w wyższej rozdzielczości nie jest dostępna.

Phylogenetic_tree_of_coronaviruses.jpg ‎(571 × 451 pikseli, rozmiar pliku: 75 KB, typ MIME: image/jpeg)

Plik Phylogenetic tree of coronaviruses.jpg znajduje się w Wikimedia Commons – repozytorium wolnych zasobów. Dane z jego strony opisu znajdują się poniżej.

Opis

OpisPhylogenetic tree of coronaviruses.jpg	English: Phylogenetic analysis of RNA-dependent RNA polymerases (Pol) of coronaviruses with complete genome sequences available. The tree was constructed by the neighbor-joining method and rooted using Breda virus polyprotein. Bootstrap values were calculated from 1000 trees. 1118 amino acid positions in Pol were included. The scale bar indicates the estimated number of substitutions per 20 amino acids. All abbreviations for the coronaviruses were the same as those in Figure 1.
Data	24 sierpnia 2010
Źródło	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3185738/
Autor	Patrick C. Y. Woo, Yi Huang, Susanna K. P. Lau, and Kwok-Yung Yuen

Licencja

Ten plik udostępniony jest na licencji Creative Commons Uznanie autorstwa 3.0.

Wolno:

dzielić się – kopiować, rozpowszechniać, odtwarzać i wykonywać utwór
modyfikować – tworzyć utwory zależne

Na następujących warunkach:

uznanie autorstwa – musisz określić autorstwo utworu, podać link do licencji, a także wskazać czy utwór został zmieniony. Możesz to zrobić w każdy rozsądny sposób, o ile nie będzie to sugerować, że licencjodawca popiera Ciebie lub Twoje użycie utworu.

Historia pliku

Kliknij na datę/czas, aby zobaczyć, jak plik wyglądał w tym czasie.

	Data i czas	Miniatura	Wymiary	Użytkownik	Opis
aktualny	04:42, 7 mar 2020		571 × 451 (75 KB)	Guest2625	Uploaded a work by Patrick C. Y. Woo, Yi Huang, Susanna K. P. Lau, and Kwok-Yung Yuen from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3185738/ with UploadWizard

Lokalne wykorzystanie pliku

Żadna strona nie korzysta z tego pliku.

Globalne wykorzystanie pliku

Ten plik jest wykorzystywany także w innych projektach wiki:

Wykorzystanie na bn.wikipedia.org
- করোনাভাইরাস
Wykorzystanie na en.wikipedia.org
- Coronavirus
Wykorzystanie na fa.wikipedia.org
- کروناویروس
Wykorzystanie na fr.wikipedia.org
- Coronavirus
Wykorzystanie na ig.wikipedia.org
- Nje Korona
Wykorzystanie na sq.wikipedia.org
- Koronavirusi
Wykorzystanie na su.wikipedia.org
- Koronavirus

Metadane

Niniejszy plik zawiera dodatkowe informacje, prawdopodobnie dodane przez aparat cyfrowy lub skaner użyte do wygenerowania tego pliku.

Jeśli plik był modyfikowany, dane mogą być częściowo niezgodne z parametrami zmodyfikowanego pliku.

Tytuł lub opis obrazu	The drastic increase in the number of coronaviruses discovered and coronavirus genomes being sequenced have given us an unprecedented opportunity to perform genomics and bioinformatics analysis on this family of viruses. Coronaviruses possess the largest genomes (26.4 to 31.7 kb) among all known RNA viruses, with G + C contents varying from 32% to 43%. Variable numbers of small ORFs are present between the various conserved genes (ORF1ab, spike, envelope, membrane and nucleocapsid) and downstream to nucleocapsid gene in different coronavirus lineages. Phylogenetically, three genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus and Gammacoronavirus, with Betacoronavirus consisting of subgroups A, B, C and D, exist. A fourth genus, Deltacoronavirus, which includes bulbul coronavirus HKU11, thrush coronavirus HKU12 and munia coronavirus HKU13, is emerging. Molecular clock analysis using various gene loci revealed that the time of most recent common ancestor of human/civet SARS related coronavirus to be 1999-2002, with estimated substitution rate of 4´10-4 to 2´10-2 substitutions per site per year. Recombination in coronaviruses was most notable between different strains of murine hepatitis virus (MHV), between different strains of infectious bronchitis virus, between MHV and bovine coronavirus, between feline coronavirus (FCoV) type I and canine coronavirus generating FCoV type II, and between the three genotypes of human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1). Codon usage bias in coronaviruses were observed, with HCoV-HKU1 showing the most extreme bias, and cytosine deamination and selection of CpG suppressed clones are the two major independent biological forces that shape such codon usage bias in coronaviruses.
Autor	Patrick C. Y. Woo
Krótki tytuł	Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis
Komentarz pliku JPEG	The drastic increase in the number of coronaviruses discovered and coronavirus genomes being sequenced have given us an unprecedented opportunity to perform genomics and bioinformatics analysis on this family of viruses. Coronaviruses possess the largest genomes (26.4 to 31.7 kb) among all known RNA viruses, with G + C contents varying from 32% to 43%. Variable numbers of small ORFs are present between the various conserved genes (ORF1ab, spike, envelope, membrane and nucleocapsid) and downstream to nucleocapsid gene in different coronavirus lineages. Phylogenetically, three genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus and Gammacoronavirus, with Betacoronavirus consisting of subgroups A, B, C and D, exist. A fourth genus, Deltacoronavirus, which includes bulbul coronavirus HKU11, thrush coronavirus HKU12 and munia coronavirus HKU13, is emerging. Molecular clock analysis using various gene loci revealed that the time of most recent common ancestor of human/civet SARS related coronavirus to be 1999-2002, with estimated substitution rate of 4´10-4 to 2´10-2 substitutions per site per year. Recombination in coronaviruses was most notable between different strains of murine hepatitis virus (MHV), between different strains of infectious bronchitis virus, between MHV and bovine coronavirus, between feline coronavirus (FCoV) type I and canine coronavirus generating FCoV type II, and between the three genotypes of human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1). Codon usage bias in coronaviruses were observed, with HCoV-HKU1 showing the most extreme bias, and cytosine deamination and selection of CpG suppressed clones are the two major independent biological forces that shape such codon usage bias in coronaviruses.
Słowa kluczowe	coronavirus genome bioinformatics

Plik:Phylogenetic tree of coronaviruses.jpg

Opis

Licencja

Podpisy

Obiekty przedstawione na tym zdjęciu

przedstawia

Drzewo filogenetyczne

status praw autorskich

chroniony prawem autorskim

licencja

CC BY 3.0

data utworzenia lub powstania

24 sie 2010

typ MIME

image/jpeg

Historia pliku

Lokalne wykorzystanie pliku

Globalne wykorzystanie pliku

Metadane