Swoją karierę piłkarską Hoekstra rozpoczynał w amatorskich klubach De Zerwers i VV Capelle. Następnie podjął treningi w Feyenoordzie. W 1981 roku awansował do kadry pierwszego zespołu. 10 kwietnia 1982 zadebiutował w jego barwach w Eredivisie w przegranym 0:1 wyjazdowym meczu z AZ Alkmaar. W sezonie 1982/1983 stał się podstawowym zawodnikiem Feyenoordu. W sezonie 1983/1984 wywalczył z Feyenoordem swoje jedyne w karierze mistrzostwo Holandii. W tym samym sezonie zdobył również swój jedyny Puchar Holandii w karierze. W Feyenoordzie występował do końca sezonu 1987/1988. Rozegrał w nim 181 ligowych meczów i strzelił 65 goli.
W 1988 roku Hoekstra odszedł z Feyenoordu i został zawodnikiem klubu RKC Waalwijk. Podobnie jak w Feyenoordzie, w RKC grał w podstawowym składzie. Piłkarzem RKC był do końca swojej kariery, czyli do 1994 roku.
Swój jedyny mecz w reprezentacji Holandii Hoekstra rozegrał 14 marca 1984. Holandia wygrała wówczas w towarzyskim meczu rozegranym w Amsterdamie z Danią 6:0. W 60. minucie tego meczu Hoekstra zdobył gola.