Protein Data Bank

Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania

Protein Data Bank, w skrócie PDB jest to biologiczna baza danych gromadząca dane o strukturze przestrzennej białek i kwasów nukleinowych.

Dane o tych makrocząsteczkach uzyskane m.in. za pomocą rentgenografii strukturalnej i spektroskopii NMR zawierają bibliografię, sekwencje aminokwasowe, informacje o strukturze drugorzędowej oraz, przede wszystkim, współrzędne atomów.

Na dzień 26 października 2020 r. baza PDB zawierała 170 171 następujących struktur[1]:

Metoda Białka Kwasy nukleinowe Kompleksy
białko/kwas nukleinowy
Inne W sumie
Rentgenografia strukturalna 141 144 2 158 7 188 4 150 494
Spektroskopia NMR 11 519 1 362 265 8 13 154
Mikroskopia elektronowa 4 491 47 1 478 0 6 016
Metody mieszane 167 6 3 1 177
Inne 307 4 6 13 330
W sumie 157 628 3 3577 8 940 27 170 171
Przykłady modeli strukturalnych białek z PDB

Przypisy[edytuj | edytuj kod]

  1. PDB Current Holdings Breakdown. Research Collaboratory for Structural Bioinformatics. [dostęp 2020-10-26].

Linki zewnętrzne[edytuj | edytuj kod]