Protein Data Bank
Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
Protein Data Bank, w skrócie PDB jest to biologiczna baza danych gromadząca dane o strukturze przestrzennej białek i kwasów nukleinowych.
Dane o tych makrocząsteczkach uzyskane m.in. za pomocą rentgenografii strukturalnej i spektroskopii NMR zawierają bibliografię, sekwencje aminokwasowe, informacje o strukturze drugorzędowej oraz, przede wszystkim, współrzędne atomów.
Na dzień 25 grudnia 2016 r. baza PDB zawierała 125309 zdeponowanych struktur[1]:
| Metoda | Białka | Kwasy nukleinowe | Kompleksy białko/kwas nukleinowy | Inne | W sumie |
| Rentgenografia strukturalna | 104850 | 1796 | 5381 | 4 | 112031 |
| Spektroskopia NMR | 10237 | 1187 | 237 | 8 | 11669 |
| Mikroskopia elektronowa | 939 | 30 | 333 | 0 | 1302 |
| Metody mieszane | 97 | 3 | 2 | 1 | 103 |
| Inne | 181 | 4 | 6 | 13 | 204 |
| W sumie | 116304 | 3020 | 5959 | 26 | 125309 |
Przypisy
- ↑ PDB Current Holdings Breakdown. [dostęp 2016-12-25].
