Protein Data Bank
Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
Protein Data Bank, w skrócie PDB – baza danych zawierająca przede wszystkim dane o strukturze przestrzennej białek i kwasów nukleinowych.
Dane o tych makrocząsteczkach uzyskane m.in. za pomocą rentgenografii strukturalnej i spektroskopii NMR zawierają bibliografię, sekwencje aminokwasowe, informacje o strukturze drugorzędowej oraz, przede wszystkim, współrzędne atomów.
Na dzień 2013-03-29 baza PDB zawierała 89212 zdeponowanych struktur[1]:
| Metoda | Białka | Kwasy nukleinowe | Kompleksy białko/kwas nukleinowy | Inne | W sumie |
| Rentgenografia strukturalna | 73384 | 1447 | 3775 | 2 | 78608 |
| Spektroskopia NMR | 8645 | 1025 | 192 | 7 | 9869 |
| Mikroskopia elektronowa | 349 | 41 | 124 | 0 | 514 |
| Metody mieszane | 46 | 3 | 2 | 1 | 52 |
| Inne | 146 | 4 | 6 | 13 | 169 |
| W sumie | 82570 | 2520 | 4099 | 23 | 89212 |
Przypisy
- ↑ PDB Current Holdings Breakdown. [dostęp 2013-03-29].
