Protein Data Bank

Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
Skocz do: nawigacja, szukaj

Protein Data Bank, w skrócie PDB jest to biologiczna baza danych gromadząca dane o strukturze przestrzennej białek i kwasów nukleinowych.

Dane o tych makrocząsteczkach uzyskane m.in. za pomocą rentgenografii strukturalnej i spektroskopii NMR zawierają bibliografię, sekwencje aminokwasowe, informacje o strukturze drugorzędowej oraz, przede wszystkim, współrzędne atomów.

Na dzień 25 grudnia 2016 r. baza PDB zawierała 125309 zdeponowanych struktur[1]:

Metoda Białka Kwasy nukleinowe Kompleksy białko/kwas nukleinowy Inne W sumie
Rentgenografia strukturalna 104850 1796 5381 4 112031
Spektroskopia NMR 10237 1187 237 8 11669
Mikroskopia elektronowa 939 30 333 0 1302
Metody mieszane 97 3 2 1 103
Inne 181 4 6 13 204
W sumie 116304 3020 5959 26 125309
Przykłady modeli strukturalnych białek z PDB

Przypisy

  1. PDB Current Holdings Breakdown. [dostęp 2016-12-25].

Linki zewnętrzne[edytuj]