Biblioteka genomowa: Różnice pomiędzy wersjami

[wersja nieprzejrzana]

Usunięta treść Dodana treść

Jednokolumnowy

Wersja z 17:46, 2 gru 2008

Biblioteka genomowa (też: bank genów, bank genomowy) - to kolekcja klonów (zazwyczaj bakterii), która jako całość zawiera co najmniej jedną kopię każdej sekwencji DNA obecnej w genomie organizmu, którego bibliotekę genomową utworzono.

Powstaje przez pocięcie całego genomu danego organizmu enzymami restrykcyjnymi, a następnie połączenie powstałych w ten sposób fragmentów DNA z wektorami (np. plazmidami lub kosmidami), tak że każdy wektor zawiera jeden, losowo wybrany fragment. Wektory te następnie wprowadza się do komórek bakteryjnych (np. bakterii Escherichia coli) - każda bakteria pobiera jeden wektor, a więc zawiera jeden fragment oryginalnego genomu. Taka bakteria, namnażając się, tworzy klon bakteryjny zawierający ten fragment. Tylko niektóre klony zawierają geny, część zawiera tylko fragmenty genów, większość sekwencje niekodujące. Fragmenty DNA niesione przez dwa klony mogą nakładać się na siebie, gdyż powstały przez losowe cięcie wielu kopii oryginalnego genomu. Biblioteka genomowa powinna być odpowiednio duża, aby prawdopodobieństwo, że każdy fragment oryginalnego genomu jest w niej obecny, wynosiło co najmniej 99%.

Rodzaje bibliotek genomowych

Biblioteki plazmidowe: Pojemność 10kb
Biblioteki fagowe: Pojemność 23 kb.
Biblioteki kosmidowe: Pojemnść 45 kb.
Biblioteki YAC (Yeast artificial chromosome): Pojemność 1000 kb.

Szablon:Genetyka stub

@@ Linia 1: / Linia 1: @@
 '''Biblioteka genomowa''' (też: bank genów, bank genomowy) - to kolekcja [[Klon (genetyka)|klonów]] (zazwyczaj [[bakterie|bakterii]]), która jako całość zawiera co najmniej jedną kopię każdej sekwencji [[DNA]] obecnej w [[genom]]ie organizmu, którego bibliotekę genomową utworzono.
-Powstaje przez pocięcie całego [[genom|genomu]] danego organizmu [[enzymy restrykcyjne|enzymami restrykcyjnymi]], a następnie połączenie powstałych w ten sposób fragmentów DNA z [[wektor (biologia)|wektorami]] (np. [[plazmid|plazmidami]] lub [[kosmid|kosmidami]]), tak że każdy wektor zawiera jeden, losowo wybrany fragment. Wektory te następnie wprowadza się do komórek bakteryjnych (np. bakterii [[pałeczka okrężnicy|''Escherichia coli'']]) - każda bakteria pobiera jeden wektor, a więc zawiera jeden fragment oryginalnego genomu. Taka bakteria, namnażając się, tworzy [[klon]] bakteryjny zawierający ten fragment. Tylko niektóre klony zawierają [[gen]]y, część zawiera tylko fragmenty genów, większość sekwencje niekodujące. Fragmenty DNA niesione przez dwa klony mogą nakładać się na siebie, gdyż powstały przez losowe cięcie wielu kopii oryginalnego genomu. Biblioteka genomowa powinna być odpowiednio duża, aby prawdopodobieństwo, że ''każdy'' fragment oryginalnego genomu jest w niej obecny, wynosiło co najmniej 99%.
+Powstaje przez pocięcie całego [[genom|genomu]] danego organizmu [[enzymy restrykcyjne|enzymami restrykcyjnymi]], a następnie połączenie powstałych w ten sposób fragmentów DNA z [[Wektor genetyczny|wektorami]] (np. [[plazmid|plazmidami]] lub [[kosmid|kosmidami]]), tak że każdy wektor zawiera jeden, losowo wybrany fragment. Wektory te następnie wprowadza się do komórek bakteryjnych (np. bakterii [[pałeczka okrężnicy|''Escherichia coli'']]) - każda bakteria pobiera jeden wektor, a więc zawiera jeden fragment oryginalnego genomu. Taka bakteria, namnażając się, tworzy [[klon]] bakteryjny zawierający ten fragment. Tylko niektóre klony zawierają [[gen]]y, część zawiera tylko fragmenty genów, większość sekwencje niekodujące. Fragmenty DNA niesione przez dwa klony mogą nakładać się na siebie, gdyż powstały przez losowe cięcie wielu kopii oryginalnego genomu. Biblioteka genomowa powinna być odpowiednio duża, aby prawdopodobieństwo, że ''każdy'' fragment oryginalnego genomu jest w niej obecny, wynosiło co najmniej 99%.
 == Rodzaje bibliotek genomowych ==