Anti-Q RNA
Anti-Q RNA (wcześniej zwany Qa RNA) – mały niekodujący RNA obecny w podlegającym koniugacji plazmidzie pCF10 bakterii Enterococcus faecalis. Należy do elementów cis-regulacyjnych swojego targetu prgQ, choć może także działać w sposób trans. Anti-Q znany jest z interakcji cząsteczkami pełniącymi funkcję intrinsic terminator bądź atenuatorem, zabezpieczając dalej leżące geny przed transkrypcją[1][2]. Taki sposób regulacji polega na tej samej zasadzie co tzw. countertranscript-driven attenuators, kontrolujące ilość kopii pT181[3], pAMbeta1[4] i pIP501[5] oraz spokrewnionych z nimi plazmidów gronkowcowych.
Anti-Q ulega transkrypcji z tego samego segmentu DNA co prgQ, nie licząc przeciwnego łańcucha, w efekcie czego jest on dokładnie komplementarny do części prgQ. Dalsze doświadczenia przyniosły potwierdzenie eksperymentalne pierwotnej konsensusowej struktury drugorzędowej i pokazała, że jedynie pewne regiony Anti-Q wchodzą w interakcje z prgQ[6].
Przypisy[edytuj | edytuj kod]
- ↑ T Bae, Kozlowicz BK, Dunny GM. Characterization of cis-acting prgQ mutants: evidence for two distinct repression mechanisms by Qa RNA and PrgX protein in pheromone-inducible enterococcal plasmid pCF10. „Mol Microbiol”. 51 (1), s. 271–281, 2004. DOI: 10.1046/j.1365-2958.2003.03832.x. PMID: 14651627.
- ↑ Johnson CM, Manias DA, Haemig HA, Shokeen S, Weaver KE, Henkin TM, Dunny GM. Direct evidence for control of the pheromone-inducible prgQ operon of Enterococcus faecalis plasmid pCF10 by a countertranscript-driven attenuation mechanism. „J Bacteriol”. 192 (6), s. 1634–42, 2010. DOI: 10.1128/JB.01525-09. PMID: 20097859. PMCID: PMC2832536.
- ↑ Novick RP, Iordanescu S, Projan SJ, Kornblum J, Edelman I. pT181 plasmid replication is regulated by a countertranscript-driven transcriptional attenuator. „Cell”. 59 (2), s. 395–404, 1989. DOI: 10.1016/0092-8674(89)90300-0. PMID: 2478296.
- ↑ Le Chatelier E, Ehrlich SD, Jannière L. Countertranscript-driven attenuation system of the pAM beta 1 repE gene. „Mol Microbiol”. 20 (5), s. 1099–112, 1996. DOI: 10.1111/j.1365-2958.1996.tb02550.x. PMID: 8809762.
- ↑ Brantl S, Birch-Hirschfeld E, Behnke D. RepR protein expression on plasmid pIP501 is controlled by an antisense RNA-mediated transcription attenuation mechanism. „J Bacteriol”. 175 (13), s. 4052–61, 1993. PMID: 8320221. PMCID: PMC204834.
- ↑ Shokeen S, Johnson CM, Greenfield TJ, Manias DA, Dunny GM, E Weaver K. Structural analysis of the Anti-Q-Qs interaction: RNA-mediated regulation of E. faecalis plasmid pCF10 conjugation. „Plasmid”. 64 (1), s. 26–35, 2010. DOI: 10.1016/j.plasmid.2010.03.002. PMID: 20332003. PMCID: PMC2892192.