Białko rybosomalne L38
Białko rybosomalne L38 (ang. 60S ribosomal protein L38) – białko wchodzące w skład podjednostki 60S rybosomu[1].
U człowieka kodowane jest genem RPL38[2][1].
Genetyka
[edytuj | edytuj kod]Ludzki gen RPL38 znajduje się na ramieniu długim chromosomu 17, dokładniej w 17q25.1. Składa się z 5 eksonów rozrzuconych na długości 6223 par zasad. Nukleotyd 213 otwiera ramkę odczytu. Następnie kodowane jest białko z 70 reszt aminoacylowych. Zidentyfikowano alternatywne warianty splicingowe, kodujące to samo białko. Co typowe dla białek rybosomalnych, w genomie leżą rozrzucone rozliczne pseudogeny tego genu. Jeden z nich ulokowany jest w regionie promotorowym genu kodującego typ 1 receptora dla angiotensyny II[1].
Funkcja
[edytuj | edytuj kod]Białko rybosomalne L38 wchodzi w skład podjednostki 60S. Jest to (obok podjednostki 40S) większa z podjednostek budujących eukariotyczny rybosom, czyli organellum komórkowe katalizujące syntezę białek. Wymienione dwie podjednostki razem składają się z 4 rodzajów RNA i około 80 strukturalnie odrębnych białek, wśród nich właśnie białko kodowane przez gen RPL38. Należy ono do rodziny białek rybosomalnych L38E. Jako białko rybosomalne ulokowane jest w cytoplazmie[1].
Białko to odgrywa ważną rolę w embiogenezie, na wczesnym jej etapie. Pełni też ważne funkcje w rozwoju szkieletu[3].
Informacje o roli tego białka w tworzeniu kośćca pochodzą z badań na myszach. Z jego brakiem wiążą się fenotypy myszy Tail-short (Ts), Tail-short shionogi (Tss) i Rabo torcido (Rbt). Ich przedstawiciele są do siebie podobni. Łączy je krótki, zwinięty ogon, różne nieprawidłowości w budowie szkieletu oraz cewy nerwowej[3].
Dla przykładu mysi fenotyp Ts wiąże się z liczącą około 18000 par zasad delecją, obejmująca cały gen Rpl38, opisaną po raz pierwszy przez Morgana[4]. W przypadku homozygoty Ts mysz umiera po około 3–4 dniach ciąży. Heterozygoty Ts/+ rozwijają na etapie embrionalnym niedokrwistość i malformacje szkieletowe. Podczas okresu perinatalnego około 30% osobników heterozygotycznych umiera. Przetrwałe osobniki heterozygotyczne Ts wykazują znaczne zmiany ogona, skróconego, skręconego bądź zniekształconego w inny sposób[5]. Ważą również mniej od innych zwierząt z tego samego miotu, cechują się jednak taką samą długością życia. Dodatkowo myszy Ts rozwijają głuchotę przewodzeniową niedługo po rozwinięciu się słuchu w wieku około 3–4 tygodni. Utrata słuchu wynika z ektopowego kostnienia wzdłuż brzegu okienka okrągłego na zewnątrz ślimaka, masywnej depozycji kryształów cholesterolu w uchu środkowym, powiększonej trąbki słuchowej i przewlekłego zapalenia ucha środkowego z wysiękiem krwistym[4].
U muszki owocowej utrata funkcji alleli RPL38 powoduje śmierć embrionów homozygotycznych oraz przedłużenie wzrostu i skrócenie włosków heterozygot. Z powodu niewydolności haploidalnej powstałej w wyniku mutacji fenotyp taki dziedziczy się jako cecha dominująca[6].
Przypisy
[edytuj | edytuj kod]- ↑ a b c d Entrez Gene: RPL38 ribosomal protein L38. (ang.).
- ↑ Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, Davis E, Goodman N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC. A map of 75 human ribosomal protein genes. „Genome Res”. 8 (5), s. 509–23, Aug 1998. DOI: 10.1101/gr.8.5.509. PMID: 9582194. (ang.).
- ↑ a b Maki Yoshihama, Tamayo Uechi, Shuichi Asakawa, Kazuhiko Kawasaki, Seishi Kato, Sayomi Higa, Noriko Maeda, Shinsei Minoshima, Tatsuo Tanaka, Nobuyoshi Shimizu & Naoya Kenmochi. The Human Ribosomal Protein Genes: Sequencing and Comparative Analysis of 73 Genes. „Genome Research”. 12 (3), s. 379–390, 2002. DOI: 10.1101/gr.214202. (ang.).
- ↑ a b Noben-Trauth K, Latoche JR. Ectopic Mineralization in the Middle Ear and Chronic Otitis Media with Effusion Caused by RPL38 Deficiency in the Tail-short (Ts) Mouse. „J. Biol. Chem.”. 286 (4), s. 3079–3093, January 2011. DOI: 10.1074/jbc.M110.184598. PMID: 21062742. (ang.).
- ↑ WC Morgan. A new tail-short mutation in the mouse whose lethal effects are conditioned by the residual genotypes. „The Journal of heredity”. 41 (8), s. 208–15, 1950. PMID: 14779008. (ang.).
- ↑ S. J. Marygold, C. Coelho, S. Leevers. Genetic Analysis of RpL38 and RpL5, Two Minute Genes Located in the Centric Heterochromatin of Chromosome 2 of Drosophila melanogaster. „Genetics”. 169 (2), s. 683–695, 2005. DOI: 10.1534/genetics.104.034124. PMID: 15520262. (ang.).