Rozgrywki toczyły się w dwóch grupach: Zapad (Zachód) oraz Istok (Wschód) i występowało w nich łącznie 36 drużyn. Po zakończeniu sezonu mistrzowie każdej grupy awansowali bezpośrednio do Prvej ligi SR Јugoslavije, a ostatnie drużyny spadły do Srpskiej ligi lub Crnogorskiej ligi.
FK Mačva Šabac, FK Zastava Kragujevac, FK Rudar Kostolac, FK Mladost Smederevska Palanka, FK Mačva Bogatić, FK Šumadija Aranđelovac, FK Badnjevac i FK Polimlje Prijepolje spadły do Srpskiej ligi 1998/99.
FK Mladost Bački Jarak, FK Napredak Kušiljevo, FK Solunac Karađorđevo, FK Vučje, FK Balkan Mirijevo i FK Radnički Pirot spadły do Srpskiej ligi 1998/99.