W 2004 roku Zé Carlos reprezentował barwy Noroeste Bauru, a następnie trafił do drużyny Portuguesa São Paulo. W niej grał do maja 2005 roku, po czym zakończył piłkarską karierę.
W 1998 roku Mário Zagallo powołał Zé Carlosa do kadry reprezentacji Brazylii na Mistrzostwa Świata we Francji. Na turnieju tym wychowanek São José EC pełnił rolę rezerwowego i wystąpił tylko w wygranym po rzutach karnych półfinałowym pojedynku z Holandią. Brazylijczycy w finale przegrali z Francją 0:3 i wywalczyli drugie miejsce. Po mistrzostwach Zé Carlos nie pojawił się już w drużynie narodowej, dla której rozegrał łącznie tylko jedno spotkanie.
