São Paulo Futebol Clube (zwany ówcześnie przez kibiców São Paulo da Floresta), będący bezpośrednim poprzednikiem dzisiejszej, słynnej, noszącej tę samą nazwę, drużyny powstał 26 stycznia 1930 roku w wyniku połączenia dwóch klubów: Clube Atlético Paulistano oraz Associação Atlética das Palmeiras. W 1929 roku musiały one zakończyć działalność swoich sekcji piłkarskich, gdyż wkraczający powoli do futbolu profesjonalizm uniemożliwił im konkurowanie z drużynami zawodowymi. W ten sposób, dzięki połączonym siłom kibiców, działaczy oraz piłkarzy obu klubów założono São Paulo F.C., którego zawodnicy od tej pory występowali w strojach z poziomymi pasami o barwach będących symbolami byłych drużyn: czerwonej i białej (C.A. Paulistano) oraz białej i czarnej (A.A. das Palmeiras). Swoje mecze zespół z São Paulo rozgrywał na stadionie Chácara da Floresta (stąd popularna nazwa drużyny) przejętym od A.A. das Palmeiras. Prezesem nowego klubu został wybrany Edgard de Souza Aranha.
W pierwszym roku istnienia klub został wicemistrzem stanu São Paulo (Campeonato Paulista), ulegając tylko słynnej drużynie Corinthians, a w kolejnym (1931) już świętował zdobycie tytułu. W trzech następnych sezonach São Paulo kończyło rozgrywki zawsze na 2. miejscu, przegrywając w każdym z nich z innym wielkim klubem, Palestra Itália (dzisiejszy Palmeiras). Pogłębiający się kryzys finansowy klubu, a także rozłam w związku piłkarskim stanu São Paulo, doprowadził do fuzji z Clube de Regatas Tietê i rozwiązania sekcji piłki nożnej, które nastąpiło 14 maja 1935 roku. Duża część piłkarzy wyjechała do Rio de Janeiro, natomiast zawodnicy, którzy zostali, oraz grupa działaczy niemogących się pogodzić z utratą klubu ustanowili Grêmio Tricolor, które 4 czerwca 1935 roku przerodziło się w Clube Atlético São Paulo, aby ostatecznie 16 grudnia 1935 roku dać początek istnieniu jednego z najsłynniejszych klubów świata – São Paulo Futebol Clube. Nowy-stary klub przejął wszelkie symbole (nazwę, barwy, herb, wzór strojów) od São Paulo da Floresta, dlatego też często uznawany jest za naturalnego kontynuatora jego tradycji i spadkobiercę sukcesów sportowych.
Oprócz skrótu nazwy klubu, w herbie umieszczone są barwy czerwona, biała i czarna, mające symbolizować kolory klubów, z połączenia których powstało São Paulo F.C.: C.A. Paulistano oraz A.A. das Palmeiras. Trzy czerwone gwiazdy oznaczają dwukrotne zdobycie Pucharu Interkontynentalnego (1992 i 1993) oraz tytuł Klubowego Mistrza Świata (2005). Dwie złote uhonorowują rekord olimpijski i rekord świata ustanowione przez reprezentanta klubu, trójskoczka Adhemara Ferreirę da Silvę podczas Igrzysk Olimpijskich w Helsinkach (1952) oraz Igrzysk Panamerykańskich w Meksyku (1955).
Maskotką klubu jest Santo Paulo (Święty Paweł), ubrany w biały habit roześmiany staruszek z białą brodą i piłką w ręce. Została stworzona w latach 40. przez rysownika czasopisma "A Gazeta Esportiva". Nazwana została "Santo" (wbrew regułom języka portugalskiego) w celu odróżnienia jej od nazwy klubu i miasta.
Drużyna São Paulo F.C. rozgrywa swoje mecze na Estádio Cícero Pompeu de Toledo, noszącym imię byłego prezesa klubu, który zainicjował budowę obiektu. Znany także powszechnie jako Morumbi, znajduje się on w dzielnicy o tej samej nazwie, leżącej w południowej części miasta. Został zaprojektowany przez João Batistę Vilanovę Artigasa, a jego budowa trwała w latach 1952-1970, choć inauguracja odbyła się jeszcze w trakcie konstruowania obiektu. W pierwszym meczu drużyna gospodarzy pokonała portugalski Sporting Lizbona 1-0, 2 października 1960 roku. Obecnie stadion, po kilku modernizacjach, mieści około 80 tys. widzów i jest największym tego typu obiektem w stanie São Paulo, a w całej Brazylii ustępuje pojemnością tylko słynnej Maracanie. Przed oddaniem Morumbi do użytku klub rozgrywał domowe mecze także na innych stadionach: Chácara da Floresta (lata 1930-35), Parque Antárctica (1936-38), Antárctica Paulista (1936-42) oraz Pacaembu (1940-60).
São Paulo FC jest rekordzistą pod względem liczby tytułów Mistrza Brazylii (6) oraz jedynym klubem w historii, który zdobył ten tytuł 3 razy z rzędu. Jako jedyna brazylijska drużyna zdobyło 3-krotnie Copa Libertadores oraz jest jedną z dwóch (obok Santosu FC), które wygrały 2-krotnie Puchar Interkontynentalny.
São Paulo w Campeonato Brasileiro rozegrało 37 sezonów (lata 1971-2008), wszystkie w najwyższej klasie rozgrywkowej. W mistrzostwach nie wystąpili tylko raz – w 1979 roku – z powodu zamieszania organizacyjnego pomiędzy stanowym (FPF) a krajowym (CBF) związkiem piłki nożnej.
I liga brazylijska (Campeonato Brasileiro Série A)
I liga stanowa (Campeonato Paulista)
