Ostatni uniwersalny wspólny przodek: Różnice pomiędzy wersjami

Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
[wersja przejrzana][wersja przejrzana]
Usunięta treść Dodana treść
Pisum (dyskusja | edycje)
drobne merytoryczne
Pisum (dyskusja | edycje)
drobne merytoryczne
Linia 1: Linia 1:
[[Plik:Deinococcus radiodurans.jpg|thumb|Ostatni uniwersalny wspólny przodek mógł być podobny do niezwykle odpornej bakterii ''[[Deinococcus radiodurans]]'']]
[[Plik:Deinococcus radiodurans.jpg|thumb|Ostatni uniwersalny wspólny przodek mógł być podobny do niezwykle odpornej bakterii ''[[Deinococcus radiodurans]]'']]
'''Ostatni uniwersalny wspólny przodek''' ([[język angielski|ang.]] ''last universal common ancestor'', '''LUCA'''), '''ostatni uniwersalny przodek''' (ang. ''last universal ancestor'', '''LUA''') – hipotetyczny [[organizm]], który był [[Ostatni wspólny przodek|ostatnim wspólnym przodkiem]] wszystkich żyjących obecnie na [[Ziemia|Ziemi]], należących do [[Domena (biologia)|domeny]] [[bakterie|bakterii]], [[Archeony|archeanów]] i [[eukarionty|eukariontów]]{{r|Woese-1990}}{{r|Woese-1998}}. Pogląd o istnieniu organizmu, który dał początek wszystkim występującym obecnie organizmów jest szeroko rozpowszechniony wśród biologów. Natura wspólnego przodka może być poznana jedynie poprzez molekularne badania struktury i sekwencji elementów współczesnych organizmów. Efektem analiz jest stworzenie drzewa życia, czyli [[drzewo filogenetyczne|drzewa filogenetycznego]] obejmującego wszystkie trzy domeny{{r|Woese-1998}}. Według jednych hipotez taki pierwotny organizm miał budowę i cechy zbliżone do bakterii hipertermofilnych, jednak wiele nowych danych wskazuje że LUCA był termofilnym lub mezofilnym proteoeukariontem, od którego pochodzą współczesne eukarionty a bakterie i archeany pojawiły się na jego wczesnych etapach ewolucji{{r|Glansdorff-2000}}{{r|Xu-2002}}{{r|Glansdorff-2008}}. Pochodzący od progenotów proteoeukariont mógł zawierać DNA, jednak za prawdopodobne uznaje się, że genom tego organizmu był zbudowany z RNA, a zmiana na DNA nastąpiła dopiero po wykształceniu trzech domen{{r|Glansdorff-2008}}.
'''Ostatni uniwersalny wspólny przodek''' ([[język angielski|ang.]] ''last universal common ancestor'', '''LUCA'''), '''ostatni uniwersalny przodek''' (ang. ''last universal ancestor'', '''LUA''') – hipotetyczny [[organizm]], który był [[Ostatni wspólny przodek|ostatnim wspólnym przodkiem]] wszystkich żyjących obecnie na [[Ziemia|Ziemi]], należących do [[Domena (biologia)|domeny]] [[bakterie|bakterii]], [[Archeony|archeanów]] i [[eukarionty|eukariontów]]{{r|Woese-1990}}{{r|Woese-1998}}. Pogląd o istnieniu organizmu, który dał początek wszystkim występującym obecnie organizmów jest szeroko rozpowszechniony wśród biologów. Natura wspólnego przodka może być poznana jedynie poprzez molekularne badania struktury i sekwencji elementów współczesnych organizmów. Efektem analiz jest stworzenie drzewa życia, czyli [[drzewo filogenetyczne|drzewa filogenetycznego]] obejmującego wszystkie trzy domeny{{r|Woese-1998}}. Według jednych hipotez taki pierwotny organizm miał budowę i cechy zbliżone do bakterii hipertermofilnych, jednak wiele nowych danych wskazuje że LUCA był termofilnym lub mezofilnym proteoeukariontem, od którego pochodzą współczesne eukarionty a bakterie i archeany pojawiły się na jego wczesnych etapach ewolucji{{r|Glansdorff-2000}}{{r|Xu-2002}}{{r|Glansdorff-2008}}. Pochodzący od progenotów proteoeukariont mógł zawierać DNA, jednak za prawdopodobne uznaje się, że genom tego organizmu był zbudowany z RNA, a zmiana na DNA nastąpiła dopiero po wykształceniu trzech domen{{r|Glansdorff-2008}}.

== Genom ==
Większość szacunków uznaje, że genom LUCA musiał zawierać co najmniej 500-1000 genów{{r|Mushegian-2008}}. Założenie, że hipotetyczny genom przodka wszystkich domen powinien być mały i zbliżony do prostych organizmów pasożytniczych nie jest jednak poparte dowodami. Liczba rodzin genów u prokariontów mieści się w granicach 1006 do 1189, a u eukariontów pomiędzy 1344 a 1529. Bardziej prawdopodobne jest, że genom LUCA zawierał liczbę genów porównywalną z wolno żyjącymi współczesnymi prokariotami{{r|Ouzounis-2006}}.


== Rozwój hipotezy ==
== Rozwój hipotezy ==
[[Plik:Phylogenetic tree.svg|mały|Drzewo życia ze wspólnym przodkiem w postaci pojedynczej [[komórka|komórki]]{{r|Doolittle-2000}}]]
[[Plik:Phylogenetic tree.svg|mały|Drzewo życia ze wspólnym przodkiem w postaci pojedynczej [[komórka|komórki]]{{r|Doolittle-2000}}]]
[[Plik:PhylogeneticTree horizontal transfers.png|mały|Drzewo życia ze wspólnym przodkiem jako społecznością organizmów między którymi dochodzi do [[poziomy transfer genów|poziomego transferu genów]]{{r|Doolittle-2000}}]]
[[Plik:PhylogeneticTree horizontal transfers.png|mały|Drzewo życia ze wspólnym przodkiem jako społecznością organizmów między którymi dochodzi do [[poziomy transfer genów|poziomego transferu genów]]{{r|Doolittle-2000}}]]
Hipoteza zakładająca istnienie uniwersalnego wspólnego przodka wszystkich organizmów jest podstawą współczesnej [[teoria ewolucji|teorii ewolucji]]. Została przedstawiona już przez Darwina w dziele "[[O powstawaniu gatunków]]". Dotychczas nie udało się empirycznie rozstrzygnąć czy życie na Ziemi jest całkowicie monofiletyczne, jeden gatunek dał początek wszystkim, czy też jak sugerują niektórzy naukowcy na wczesnym etapie rozwoju życia [[poziomy transfer genów]] był na tyle powszechny, że monofiletyzm życia nie jest możliwy{{r|Theobald-2010}}. Niezależnie od tego czy LUCA był jednym gatunkiem, czy współpracującą ze sobą grupą organizmów jego istnienie datowane jest na 3,5-3,8 mld lat temu{{r|Doolittle-2000}}. Najbardziej podstawowy podział na trzy domeny wywodzące się od wspólnego przodka zaproponowali Fox i Woese w roku 1977 na podstawie sekwencji rRNA{{r|White-2003}}. Kolejne badania molekularne doprowadziły do wniosku, że jako pierwsze oddzieliły się bakterie. Następnie ze wspólnej linii powstały eukarionty i archeany. [[Jądro komórkowe]] eukariontów mogło powstać w wyniku wbudowania w komórkę kompleksu [[wirus]]ów DNA{{r|Ranea-2006}}.
Hipoteza zakładająca istnienie uniwersalnego wspólnego przodka wszystkich organizmów jest podstawą współczesnej [[Ewolucja (biologia)|teorii ewolucji]]. Została przedstawiona już przez Darwina w dziele "[[O powstawaniu gatunków]]". Dotychczas nie udało się empirycznie rozstrzygnąć czy życie na Ziemi jest całkowicie monofiletyczne, jeden gatunek dał początek wszystkim, czy też jak sugerują niektórzy naukowcy na wczesnym etapie rozwoju życia [[poziomy transfer genów]] był na tyle powszechny, że monofiletyzm życia nie jest możliwy{{r|Theobald-2010}}. Niezależnie od tego czy LUCA był jednym gatunkiem, czy współpracującą ze sobą grupą organizmów jego istnienie datowane jest na 3,5-3,8 mld lat temu{{r|Doolittle-2000}}. Najbardziej podstawowy podział na trzy domeny wywodzące się od wspólnego przodka zaproponowali Fox i Woese w roku 1977 na podstawie sekwencji rRNA{{r|White-2003}}. Kolejne badania molekularne doprowadziły do wniosku, że jako pierwsze oddzieliły się bakterie. Następnie ze wspólnej linii powstały eukarionty i archeany. [[Jądro komórkowe]] eukariontów mogło powstać w wyniku wbudowania w komórkę kompleksu [[Wirusy|wirusów]] DNA{{r|Bell-2001}}{{r|Bell-2009}}.

== Genom i proteom==
Większość szacunków uznaje, że genom LUCA musiał zawierać co najmniej 500-1000 genów{{r|Mushegian-2008}}. Założenie, że hipotetyczny genom przodka wszystkich domen powinien być mały i zbliżony do prostych organizmów pasożytniczych nie jest jednak poparte dowodami. Liczba rodzin genów u prokariontów mieści się w granicach 1006 do 1189, a u eukariontów pomiędzy 1344 a 1529. Bardziej prawdopodobne jest, że genom LUCA zawierał liczbę genów porównywalną z wolno żyjącymi współczesnymi prokariotami{{r|Ouzounis-2006}}. Zidentyfikowano co najmniej 140 domen białek tworzących prawdopodobnie [[proteom]] LUCA{{r|Ranea-2006}}. Rekonstrukcja sekwencji domen białkowych wskazuje, że charakteryzowały się one wysoką hydrofobowością{{r|Mannige-2012}}.


== Przypisy ==
== Przypisy ==
Linia 19: Linia 19:
<ref name="Glansdorff-2000">{{Cytuj pismo | nazwisko = Glansdorff | imię = N. | tytuł = About the last common ancestor, the universal life-tree and lateral gene transfer: a reappraisal | czasopismo = Mol Microbiol | wolumin = 38 | numer = 2 | strony = 177-175 | rok = 2000 | doi = 10.1046/j.1365-2958.2000.02126.x | pmid = 11069646}}</ref>
<ref name="Glansdorff-2000">{{Cytuj pismo | nazwisko = Glansdorff | imię = N. | tytuł = About the last common ancestor, the universal life-tree and lateral gene transfer: a reappraisal | czasopismo = Mol Microbiol | wolumin = 38 | numer = 2 | strony = 177-175 | rok = 2000 | doi = 10.1046/j.1365-2958.2000.02126.x | pmid = 11069646}}</ref>
<ref name="Xu-2002">{{Cytuj pismo | nazwisko = Xu | imię = Y. | nazwisko2 = Glansdorff | imię2 = N. | tytuł = Was our ancestor a hyperthermophilic procaryote? | czasopismo = Comp Biochem Physiol A Mol Integr Physiol | wolumin = 133 | numer = 3 | strony = 677-688 | rok = 2002 | doi = 10.1016/S1095-6433(02)00197-6 | pmid = 12443925}}</ref>
<ref name="Xu-2002">{{Cytuj pismo | nazwisko = Xu | imię = Y. | nazwisko2 = Glansdorff | imię2 = N. | tytuł = Was our ancestor a hyperthermophilic procaryote? | czasopismo = Comp Biochem Physiol A Mol Integr Physiol | wolumin = 133 | numer = 3 | strony = 677-688 | rok = 2002 | doi = 10.1016/S1095-6433(02)00197-6 | pmid = 12443925}}</ref>
<ref name="Theobald-2010">{{Cytuj pismo | nazwisko = Theobald | imię = DL. | tytuł = A formal test of the theory of universal common ancestry | czasopismo = Nature | wolumin = 465 | numer = 7295 | strony = 219-222 | rok = 2010 | doi = 10.1038/nature09014 | pmid = 20463738 }}</ref>
<ref name="Theobald-2010">{{Cytuj pismo | nazwisko = Theobald | imię = DL. | tytuł = A formal test of the theory of universal common ancestry | czasopismo = Nature | wolumin = 465 | numer = 7295 | strony = 219-222 | rok = 2010 | doi = 10.1038/nature09014 | pmid = 20463738}}</ref>
<ref name="Doolittle-2000">{{Cytuj pismo | nazwisko = Doolittle | imię = WF. | tytuł = Uprooting the tree of life | czasopismo = Sci Am | wolumin = 282 | numer = 2 | strony = 90-95 | rok = 2000 | doi = | pmid = 10710791 |url=http://www.scientificamerican.com/article/uprooting-the-tree-of-life/}}</ref>
<ref name="Doolittle-2000">{{Cytuj pismo | nazwisko = Doolittle | imię = WF. | tytuł = Uprooting the tree of life | czasopismo = Sci Am | wolumin = 282 | numer = 2 | strony = 90-95 | rok = 2000 | doi = | pmid = 10710791 |url=http://www.scientificamerican.com/article/uprooting-the-tree-of-life/}}</ref>
<ref name="White-2003">{{Cytuj pismo | nazwisko = White | imię = MF. | tytuł = Archaeal DNA repair: paradigms and puzzles. | czasopismo = Biochem Soc Trans | wolumin = 31 | numer = Pt 3 | strony = 690-3 | miesiąc = Jun | rok = 2003 | doi = 10.1042/ | pmid = 12773184 }}</ref>
<ref name="White-2003">{{Cytuj pismo | nazwisko = White | imię = MF. | tytuł = Archaeal DNA repair: paradigms and puzzles. | czasopismo = Biochem Soc Trans | wolumin = 31 | numer = Pt 3 | strony = 690-3 | miesiąc = Jun | rok = 2003 | doi = 10.1042/ | pmid = 12773184}}</ref>
<ref name="Ranea-2006">{{Cytuj pismo | nazwisko = Ranea | imię = Juan A. G. | nazwisko2 = Sillero | imię2 = Antonio | nazwisko3 = Thornton | imię3 = Janet M. | nazwisko4 = Orengo | imię4 = Christine A. | tytuł = Protein Superfamily Evolution and the Last Universal Common Ancestor (LUCA) | czasopismo = Journal of Molecular Evolution | wolumin = 63 | wydanie = 4 | strony = 513–525 | rok = 2006 | issn = 0022-2844 | doi = 10.1007/s00239-005-0289-7 | język = en }}</ref>
<ref name="Bell-2001">{{Cytuj pismo | nazwisko = Bell | imię = PJ. | tytuł = Viral eukaryogenesis: was the ancestor of the nucleus a complex DNA virus? | czasopismo = J Mol Evol | wolumin = 53 | numer = 3 | strony = 251-6 | miesiąc = Sep | rok = 2001 | doi = 10.1007/s002390010215 | pmid = 11523012 }}</ref>
<ref name="Bell-2009">{{Cytuj pismo | nazwisko = Bell | imię = PJ. | tytuł = The viral eukaryogenesis hypothesis: a key role for viruses in the emergence of eukaryotes from a prokaryotic world environment. | czasopismo = Ann N Y Acad Sci | wolumin = 1178 | numer = | strony = 91-105 | miesiąc = Oct | rok = 2009 | doi = 10.1111/j.1749-6632.2009.04994.x | pmid = 19845630 }}</ref>
<ref name="Ranea-2006">{{Cytuj pismo | nazwisko = Ranea | imię = JA. | nazwisko2 = Sillero | imię2 = A. | nazwisko3 = Thornton | imię3 = JM. | nazwisko4 = Orengo | imię4 = CA. | tytuł = Protein superfamily evolution and the last universal common ancestor (LUCA). | czasopismo = J Mol Evol | wolumin = 63 | numer = 4 | strony = 513-25 | miesiąc = Oct | rok = 2006 | doi = 10.1007/s00239-005-0289-7 | pmid = 17021929 }}</ref>
<ref name="Mannige-2012">{{Cytuj pismo | nazwisko = Mannige | imię = RV. | nazwisko2 = Brooks | imię2 = CL. | nazwisko3 = Shakhnovich | imię3 = EI. | tytuł = A universal trend among proteomes indicates an oily last common ancestor. | czasopismo = PLoS Comput Biol | wolumin = 8 | numer = 12 | strony = e1002839 | miesiąc = | rok = 2012 | doi = 10.1371/journal.pcbi.1002839 | pmid = 23300421 }}</ref>
}}
}}


== Linki zewnętrzne ==
== Linki zewnętrzne ==
*{{Cytuj stronę | nazwisko = Theobald | imię = Douglas | tytuł = 29+ Evidences for Macroevolution: The Scientific Case for Common Descent | url = http://www.talkorigins.org/faqs/comdesc/ | opublikowany = www.talkorigins.org | data = 1999-2012 | data dostępu = 2014-06-25 }}
*{{Cytuj stronę | nazwisko = Theobald | imię = Douglas | tytuł = 29+ Evidences for Macroevolution: The Scientific Case for Common Descent | url = http://www.talkorigins.org/faqs/comdesc/ | opublikowany = www.talkorigins.org | data = 1999-2012 | data dostępu = 2014-06-25}}


{{Ewolucja}}
{{Ewolucja}}

Wersja z 13:17, 27 cze 2014

Ostatni uniwersalny wspólny przodek mógł być podobny do niezwykle odpornej bakterii Deinococcus radiodurans

Ostatni uniwersalny wspólny przodek (ang. last universal common ancestor, LUCA), ostatni uniwersalny przodek (ang. last universal ancestor, LUA) – hipotetyczny organizm, który był ostatnim wspólnym przodkiem wszystkich żyjących obecnie na Ziemi, należących do domeny bakterii, archeanów i eukariontów[1][2]. Pogląd o istnieniu organizmu, który dał początek wszystkim występującym obecnie organizmów jest szeroko rozpowszechniony wśród biologów. Natura wspólnego przodka może być poznana jedynie poprzez molekularne badania struktury i sekwencji elementów współczesnych organizmów. Efektem analiz jest stworzenie drzewa życia, czyli drzewa filogenetycznego obejmującego wszystkie trzy domeny[2]. Według jednych hipotez taki pierwotny organizm miał budowę i cechy zbliżone do bakterii hipertermofilnych, jednak wiele nowych danych wskazuje że LUCA był termofilnym lub mezofilnym proteoeukariontem, od którego pochodzą współczesne eukarionty a bakterie i archeany pojawiły się na jego wczesnych etapach ewolucji[3][4][5]. Pochodzący od progenotów proteoeukariont mógł zawierać DNA, jednak za prawdopodobne uznaje się, że genom tego organizmu był zbudowany z RNA, a zmiana na DNA nastąpiła dopiero po wykształceniu trzech domen[5].

Rozwój hipotezy

Drzewo życia ze wspólnym przodkiem w postaci pojedynczej komórki[6]
Drzewo życia ze wspólnym przodkiem jako społecznością organizmów między którymi dochodzi do poziomego transferu genów[6]

Hipoteza zakładająca istnienie uniwersalnego wspólnego przodka wszystkich organizmów jest podstawą współczesnej teorii ewolucji. Została przedstawiona już przez Darwina w dziele "O powstawaniu gatunków". Dotychczas nie udało się empirycznie rozstrzygnąć czy życie na Ziemi jest całkowicie monofiletyczne, jeden gatunek dał początek wszystkim, czy też jak sugerują niektórzy naukowcy na wczesnym etapie rozwoju życia poziomy transfer genów był na tyle powszechny, że monofiletyzm życia nie jest możliwy[7]. Niezależnie od tego czy LUCA był jednym gatunkiem, czy współpracującą ze sobą grupą organizmów jego istnienie datowane jest na 3,5-3,8 mld lat temu[6]. Najbardziej podstawowy podział na trzy domeny wywodzące się od wspólnego przodka zaproponowali Fox i Woese w roku 1977 na podstawie sekwencji rRNA[8]. Kolejne badania molekularne doprowadziły do wniosku, że jako pierwsze oddzieliły się bakterie. Następnie ze wspólnej linii powstały eukarionty i archeany. Jądro komórkowe eukariontów mogło powstać w wyniku wbudowania w komórkę kompleksu wirusów DNA[9][10].

Genom i proteom

Większość szacunków uznaje, że genom LUCA musiał zawierać co najmniej 500-1000 genów[11]. Założenie, że hipotetyczny genom przodka wszystkich domen powinien być mały i zbliżony do prostych organizmów pasożytniczych nie jest jednak poparte dowodami. Liczba rodzin genów u prokariontów mieści się w granicach 1006 do 1189, a u eukariontów pomiędzy 1344 a 1529. Bardziej prawdopodobne jest, że genom LUCA zawierał liczbę genów porównywalną z wolno żyjącymi współczesnymi prokariotami[12]. Zidentyfikowano co najmniej 140 domen białek tworzących prawdopodobnie proteom LUCA[13]. Rekonstrukcja sekwencji domen białkowych wskazuje, że charakteryzowały się one wysoką hydrofobowością[14].

Przypisy

Szablon:Przypisy-lista

Linki zewnętrzne

  1. Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie Woese-1990
    BŁĄD PRZYPISÓW
  2. a b Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie Woese-1998
    BŁĄD PRZYPISÓW
  3. Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie Glansdorff-2000
    BŁĄD PRZYPISÓW
  4. Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie Xu-2002
    BŁĄD PRZYPISÓW
  5. a b Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie Glansdorff-2008
    BŁĄD PRZYPISÓW
  6. a b c Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie Doolittle-2000
    BŁĄD PRZYPISÓW
  7. Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie Theobald-2010
    BŁĄD PRZYPISÓW
  8. Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie White-2003
    BŁĄD PRZYPISÓW
  9. Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie Bell-2001
    BŁĄD PRZYPISÓW
  10. Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie Bell-2009
    BŁĄD PRZYPISÓW
  11. Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie Mushegian-2008
    BŁĄD PRZYPISÓW
  12. Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie Ouzounis-2006
    BŁĄD PRZYPISÓW
  13. Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie Ranea-2006
    BŁĄD PRZYPISÓW
  14. Błąd w przypisach: Błąd w składni elementu <ref>. Brak tekstu w przypisie o nazwie Mannige-2012
    BŁĄD PRZYPISÓW