Ħamrun Spartans założony został w 1907 roku. W 1918 roku klub zmienił nazwę na Ħamrun United, jednak rok później powrócił do pierwotnej nazwy. W 1921 klub ponownie zmienił nazwę - tym razem na Ħamrun Lions i znów po roku powrócił do nazwy pierwotnej, która później już nie była zmieniana. Do dziś klub zdobył 7 tytułów mistrza Malty oraz 11-krotnie został wicemistrzem Malty. Za najwybitniejszego piłkarza w historii klubu uważany jest Stefan Sultana, który w swojej karierze zdobył 252 gole, w tym 225 dla Ħamrun Spartans. Do dziś jest on najlepszym strzelcem w historii Malty. W sezonie 2007/08 klub, po powrocie do pierwszej ligi, gra jako beniaminek.
Q – runda eliminacyjna, 1/16, 1/8, 1/4, 1/2 – odpowiednia faza rozgrywek, Grupa – runda grupowa, 1r gr – pierwsza runda grupowa, 2r gr – druga runda grupowa, F – finał, R – runda, PO – play-off
k. – rzuty karne, los. – losowanie, Dogr. – dogrywka, w. – zasada bramek strzelonych na wyjeździe