VNTR

Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
Skocz do: nawigacji, wyszukiwania

VNTR (z ang. variable number tandem repeats, zmienna liczba tandemowych powtórzeń). Miejsce w genomie zawierające powtarzający się motyw nukleotydów, np. ACTACTACTACTACT... Sekwencję VNTR można zapisać w schematyczny sposób, np. (ACT)n, gdzie 'n' oznacza liczbę powtórzeń określonego motywu. W powtórzeniach tandemowych motyw ułożony jest w tym samym kierunku we wszystkich powtórzeniach (por. inverted repeats). Loci VNTR na ogół charakteryzują się wysokim poziomem zmienności w populacji. Loci VNTR można podzielić ze względu na długość motywu na: mikrosatelity o długości motywu od 1 do 5 par zasad, minisatelity o długości motywu od 6 do ok. 100 par zasad. Do sekwencji powtarzalnych należy również DNA satelitarne.

W genetyce, biologii molekularnej oraz inżynierii genetycznej technika polegająca na znajdowaniu liczby powtórzeń motywu w locus. Po raz pierwszy metoda VNTR została zastosowana w procesie tworzenia genetycznej mapy człowieka. Technika VNTR opiera się na analizie tandemowo powtarzających się sekwencjach par zasad o długości kilkunastu do kilkudziesięciu nukleotydów zwanych minisatelitarnym DNA. Liczba powtórzeń sekwencji minisatelitarnych może wynosić nawet do 1000 powtórzeń i jest często zróżnicowana wśród genotypów tego samego gatunku biologicznego co jest powodowane licznymi zdarzeniami rekombinacyjnymi.