VNTR

Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
Skocz do: nawigacja, szukaj

VNTR (z ang. variable number of tandem repeats = zmienna liczba powtórzeń tandemowych) – miejsce w genomie zawierające powtarzający się motyw nukleotydów, np. ACTACTACTACTACT... Sekwencję VNTR można zapisać w schematyczny sposób, np. (ACT)n, gdzie 'n' oznacza liczbę powtórzeń określonego motywu. Istotny jest fakt, że w powtórzeniach tandemowych powtarzające się fragmenty są ułożone jeden obok drugiego (jeśli powtarzające się fragmenty są rozdzielone innymi sekwencjami, mówi się o powtórzeniach rozproszonych, ang. interspersed repeats). Loci VNTR na ogół charakteryzują się wysokim poziomem zmienności w populacji. Można je podzielić ze względu na długość motywu na: mikrosatelity o długości motywu od 2 do 5 par zasad i minisatelity o długości motywu od 6 do ok. 100 par zasad. Do sekwencji powtarzalnych należy również DNA satelitarne.

W genetyce, biologii molekularnej oraz inżynierii genetycznej znajdowanie liczby powtórzeń motywu w locus ułatwia odczytywanie DNA organizmów. Po raz pierwszy metoda VNTR została zastosowana w procesie tworzenia genetycznej mapy człowieka. Technika VNTR opiera się na analizie tandemowo powtarzających się sekwencjach par zasad o długości kilkunastu do kilkudziesięciu nukleotydów zwanych minisatelitarnym DNA. Liczba powtórzeń sekwencji minisatelitarnych może wynosić nawet do 1000 powtórzeń i jest często zróżnicowana wśród genotypów tego samego gatunku biologicznego, co jest powodowane licznymi zdarzeniami rekombinacyjnymi.