Džemaili pochodzi z rodziny albańskiej i urodził się w macedońskim mieście Tetowo. Jeszcze jako młody chłopiec wyjechał z rodzicami z kraju i osiedlił się w Szwajcarii. Tam zaczął kopać piłkę w małym klubie FC Oerlikon. W 1996 roku trafił do FC Unterstrass, a w 2000 do SC Young Fellows Juventus z Zurychu. W 2003 roku został zawodnikiem innego klubu z rego miasta, FC Zürich. W lidze zadebiutował wcześnie bo w wieku 17 lat i już wtedy stał się zawodnikiem pierwszego składu FC. W swoim debiutanckim sezonie zajął 4. miejsce w lidze, ale już w 2006 roku Zurych nie miał sobie równych w lidze i wywalczył pierwsze od 15 lat mistrzostwo Szwajcarii. Rok później Blerim wystąpił w meczach 2. rundy eliminacyjnej do Ligi Mistrzów, ale szwajcarski klub uległ w dwumeczu Red Bull Salzburg i odpadł z dalszej rywalizacji. W tym samym sezonie obronił jednak mistrzostwo kraju, które było drugim w karierze Blerima.
Jeszcze 9 lutego 2007 Džemaili podpisał przedwstępny kontrakt z Boltonem Wanderers, a latem na zasadzie wolnego transferu ostatecznie przeszedł do tej drużyny. Przez kontuzję Džemaili nie zaliczył debiutu w barwach Boltonu, natomiast latem 2008 roku został wypożyczony do Torino FC. Po sezonie działacze włoskiego klubu za 2 miliony euro wykupili piłkarza na stałe. 31 sierpnia 2009 wypożyczyli go natomiast do Parmy. W latach 2011–2014 grał w SSC Napoli. Z kolei latem 2014 przeszedł do Galatasaray SK.
Stany Zjednoczone
