Do Szwajcarii przybył jako dziecko. Grał początkowo w SV Augst i młodzieżowej drużynie FC Basel. Pierwszy profesjonalny kontrakt podpisał 2 stycznia 2009 roku. W pierwszej drużynie zadebiutował w sezonie 2009/2010 12 lipca 2009 roku w meczu przeciwko FC St. Gallen na AFG Arena. 9 listopada zdobył swoją pierwszą bramkę w wygranym 4:1 meczu z Neuchâtel Xamax na St. Jakob-Park. W lutym 2012 roku podpisał kontrakt z Bayernem Monachium, który zaczął obowiązywać od 1 lipca 2012 r. 8 stycznia 2015 roku z Bayernu Monachium przeniósł się do Interu Mediolan na zasadzie wypożyczenia. Inter wykupił Xherdana za 17 milionów euro. 11 sierpnia 2015 roku został zawodnikiem Stoke City[2].
13 lipca 2018 podpisał kontrakt z Liverpoolem[3]. W swoim debiutanckim sezonie dla the Reds zdobył wicemistrzostwo Anglii z rekordowym dorobkiem 97 pkt. oraz triumfował w Lidze Mistrzów. Debiut 28.07.2018r w meczu towarzyskim z Manchesterem United (wygrany 4:1) okrasił pięknym golem z przewrotki. Shaqiri został bohaterem rozgrywanego 16.12.2018r ligowego meczu z Manchester United, w którym po wejściu z ławki rezerwowych zdobył dwa gole ustalając wynik 3:1. Wystąpił 07.05.2019r w drugim meczu półfinałowym Ligi Mistrzów z Barceloną. Po przegranym tydzień wcześniej meczu 3:0 na Camp Nou razem z drużyną odrobił straty i Liverpool wygrał rewanżowe spotkanie na Anfield 4:0. Shaqiri asystował przy jednym z trafień Gini Wijnalduma. W sezonie 2018/19 wystąpił w 30 meczach, zdobył 6 bramek i 5 asyst.
W dorosłej reprezentacji zadebiutował 3 marca 2010 roku w meczu przeciwko Urugwajowi, wchodząc z ławki rezerwowych. 11 maja 2010 roku znalazł się w 23-osobowej kadrze Szwajcarii powołanej przez Ottmara Hitzfelda na mundial w RPA. 6 września 2011 roku w meczu Eliminacji Euro 2012 strzelił hat-tricka. Na Mistrzostwach Świata 2014 w Brazylii został 50. piłkarzem w historii, który podczas mundialu zdobył hat-tricka[4].
