Klub pierwotnie nazywał się Brescia Football Club. W 1912 Brescia po raz pierwszy awansowała do Serie A, w której w następnych 7 sezonach grała 6 razy. Klub grał na przemian w Serie A lub w Serie B aż do 1982, kiedy to spadł do Serie C (odpowiednik polskiej II ligi). Brescia powróciła do Serie B w 1985. W sezonie 2000/2001, po podpisaniu kontraktu z Roberto Baggio, Brescia nieoczekiwanie zajęła 7. miejsce w Serie A. Było to najwyższe miejsce zajęte przez drużynę podczas jej występów w Serie A. Dzięki temu osiągnięciu Brescia zakwalifikowała się do rozgrywek Pucharu Intertoto, w których dotarła do finału (w finale przegrała z Paris Saint-Germain). Roberto Baggio grał w klubie przez 4 lata, aż do zakończenia kariery w 2004. Podczas jego obecności w klubie, Brescia zanotowała najdłuższy okres nieprzerwanych występów w Serie A - 5 kolejnych sezonów od 2000 do 2005 roku. Po zajęciu 19 miejsca w sezonie 2004/2005 Brescia spadła do Serie B, gdzie występowała do sezonu 2009/2010. W sezonach 2010/2011 oraz 2019/2020 Brescia występowała w Serie A. Oba sezony zakończyły się spadkiem.
1999/00 - Serie B 3. miejsce, awans do Serie A
2000/01 - Serie A 8. miejsce
2001/02 - Serie A 14. miejsce, 2001 Puchar Intertoto runner-up
2002/03 - Serie A 10. miejsce
2003/04 - Serie A 11. miejsce
2004/05 - Serie A 19. miejsce, spadł do Serie B
2008/09 - Serie B 4. miejsce, przegrane playoff (awans Livorno)
2009/10 - Serie B 3. miejsce, awansował do Serie A pokonując w finale playoff Torino
2010/11 - Serie A 19. miejsce, spadł do Serie B
2018/19 - Serie B 1. miejsce, bezpośrednio awansował do Serie A dwie kolejki przed końcem rozgrywek
Q – runda eliminacyjna, 1/16, 1/8, 1/4, 1/2 – odpowiednia faza rozgrywek, Grupa – runda grupowa, 1r gr – pierwsza runda grupowa, 2r gr – druga runda grupowa, F – finał, R – runda, PO – play-off
k. – rzuty karne, los. – losowanie, Dogr. – dogrywka, w. – zasada bramek strzelonych na wyjeździe
FC Tatabánya
Chmel Blšany
Paris Saint-Germain
Gloria Bystrzyca
Villarreal CF